小麦蛋白翻译起始因子5A基因（eIF5A）的克隆与分析

遗传 ›› 2006, Vol. 28 ›› Issue (5): 571-577.

小麦蛋白翻译起始因子5A基因（eIF5A）的克隆与分析

周建平，杨足君，冯娟，迟世华，刘成，任正隆

电子科技大学生命与技术学院，成都 610054

收稿日期:2005-09-02 修回日期:2005-12-12 出版日期:2006-05-10 发布日期:2006-05-10
通讯作者:
任正隆

Cloning and Analysis of Gene Encoding Wheat Translation Initiation Factor, eIF5A

ZHOU Jian-Ping, YANG Zu-Jun, FENG Juan, CHI Shi-Hua, LIU Cheng,
REN Zheng-Long

School of Life Science and Technology, University of Electronic Science and Technology of China, Chengdu 610054,China054

Received:2005-09-02 Revised:2005-12-12 Online:2006-05-10 Published:2006-05-10
Contact: REN Zheng-Long

摘要/Abstract

摘要： 真核生物的翻译起始因子5A （eIF5A）是调控生物生长发育、衰老及环境适应等的重要因子。利用设计的小麦蛋白翻译起始因子5A基因的引物对小麦“中国春”基因组DNA和cDNA进行PCR扩增，并将扩增的特异片段回收、克隆和测序，从基因组DNA中得到长度分别为1 679 bp、1 910 bp两条带，从cDNA扩增得到1条636 bp带，分别命名为eIF5a1（基因登录号：DQ167202）、eIF5a2（基因登录号：DQ167201）和eIF5a3。利用GeneRace方法得到eIF5a3（基因登录号：DQ167203）的全长为768 bp。序列分析表明，eIF5a1、eIF5a2具82.3%相似性，都形成636 bp的转录产物，转录产物仅6个核苷酸差异。将eIF5a1、eIF5a2和 eIF5a3这3个序列的预测氨基酸序列进行比对，发现仅有1～2个氨基酸的差异，证实它们为eIF5A基因家族的成员。进化分析表明它们与报道的玉米、水稻、西红柿、烟草的eIF5A基因序列的遗传关系最近。进一步研究表明eIF5a2位于2B染色体上，并用半定量RT-PCR 研究了小麦eIF5A基因的表达情况。

关键词: eIF5A, 小麦, 半定量RT-PCR, 进化

Abstract: Eukaryotic translation initiation factor 5A (eIF5A) is involved in cell proliferation, senescence, development and environmental response. In this paper, DNA and cDNA of Chinese Spring was amplified by PCR with special primers, two special fragments of 1 679 bp and 1 910 bp were obtained with DNA as template and one special fragment of 636 bp was yielded with cDNA as template. Which were named eIF5a1 (GenBank number: DQ167202), eIF5a2 (Genbank number: DQ167201) and eIF5a3, respectively. The complete sequence (768 bp) of eIF5a3 (Genbank number: DQ167203) was obtained using GeneRacer kit. Nucleotide sequence analysis shows that eIF5a1 and eIF5a2 share identical transcriptions of 636bp which have only 6 nucleotides difference. Putative amino acid sequences analysis revealed that there was only one or two amino acid difference in eIF5a1, eIF5a2 and eIF5a3. Phylogenic analysis indicated that the eIF5A of wheat were relation to corn, rice, tomato and potato closely. In additional, eIF5a2 is located on chromosome 2B using Langdon D-genomic disomic substitution lines and the expression of eIF5A was also investigated by Semi-quantitative PCR.

Key words: eIF5A, wheat, Semi-quantitative PCR, phylogeny

中图分类号:

Q943

周建平，杨足君，冯娟，迟世华，刘成，任正隆. 小麦蛋白翻译起始因子5A基因（eIF5A）的克隆与分析[J]. 遗传, 2006, 28(5): 571-577.

ZHOU Jian-Ping, YANG Zu-Jun, FENG Juan, CHI Shi-Hua, LIU Cheng, REN Zheng-Long . Cloning and Analysis of Gene Encoding Wheat Translation Initiation Factor, eIF5A[J]. HEREDITAS, 2006, 28(5): 571-577.

[1]	姜明亮, 郎红, 李晓楠, 祖野, 赵靖, 彭沈凌, 刘振, 战宗祥, 朴钟云. 植物孤基因研究进展[J]. 遗传, 2022, 44(8): 682-694.
[2]	巴恒星, 胡鹏飞, 李春义. 鹿科动物基因组学研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(4): 308-322.
[3]	吕孟冈, 刘艾嘉, 李庆伟, 苏鹏. RHR转录因子家族起源、功能以及进化机制的研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(3): 215-225.
[4]	章誉兴, 吴宏, 于黎. 哺乳动物毛色调控机制及其适应性进化研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(2): 118-133.
[5]	罗鑫, 宿兵. 三维基因组分析点亮人类大脑进化之谜[J]. 遗传, 2021, 43(2): 105-107.
[6]	朱医高, 李军, 逄越, 李庆伟. 七鳃鳗：生物进化和疾病研究的重要模式动物[J]. 遗传, 2020, 42(9): 847-857.
[7]	赵娜, 亓宝, 董芊里, 王晓丽. 普通小麦相关研究进展在遗传学理论教学中的应用[J]. 遗传, 2020, 42(9): 916-925.
[8]	胡风越, 王克剑. STEME系统：一种助力体内定向进化的新工具[J]. 遗传, 2020, 42(3): 231-235.
[9]	唐连超, 谷峰. CRISPR-Cas基因编辑系统升级：聚焦Cas蛋白和PAM[J]. 遗传, 2020, 42(3): 236-249.
[10]	梅志超, 位竹君, 于佳慧, 冀凤丹, 解莉楠. 多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制[J]. 遗传, 2020, 42(3): 321-331.
[11]	彭威, 冯蒙洁, 陈皓, 韩宝瑜. 双翅目昆虫基因组研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(11): 1093-1109.
[12]	史晓黎,何伊琳,凌宏清. 小麦A基因组测序与进化研究进展[J]. 遗传, 2019, 41(9): 836-844.
[13]	郑建敏,罗江陶,万洪深,李式昭,杨漫宇,李俊,杨恩年,蒋云,刘于斌,王相权,蒲宗君. 四川省小麦育成品种系谱分析及发展进程[J]. 遗传, 2019, 41(7): 599-610.
[14]	何超,沈文龙,李平,张彦,曾晶,殷作明,赵志虎. Alu元件在染色质三维结构层次上的生物信息学分析[J]. 遗传, 2019, 41(3): 254-261.
[15]	孟玉,杨若林. 基于基因家族大小的比较研究脊椎动物的适应性进化[J]. 遗传, 2019, 41(2): 158-174.