STR遗传多态性研究中样本数量对等位基因检出数量的影响

遗传 ›› 2008, Vol. 30 ›› Issue (3): 313-313―320.

STR遗传多态性研究中样本数量对等位基因检出数量的影响

高雅, 李生斌

西安交通大学医学院法医学系, 西安 710061

收稿日期:2007-08-31 修回日期:2007-10-27 出版日期:2008-03-10 发布日期:2008-03-10
通讯作者: 高雅

Effects of sample size on the observed number of allele of 9 STR loci with various genetic data

GAO Ya, LI Sheng-Bin

Faculty of Forensics, College of Medicine, Xi’an Jiaotong University, Xi’an 710061, China

Received:2007-08-31 Revised:2007-10-27 Online:2008-03-10 Published:2008-03-10

摘要/Abstract

摘要：

以30个不同民族9个常染色体STR基因座(D3S1358, vWA, FGA, TH01,TPOX, CSF1PO, D13S317, D5S818, D7S820)的群体遗传研究数据资料为例, 探讨群体遗传学研究中常染色体STR基因座等位基因检出数量与样本量之间的关系, 即样本量对等位基因检出数量的影响。结果显示, 在一定范围之内, 样本量的大小与所观测到的不同基因座等位基因检出数量之间存在正相关关系。当超过一定范围时, 样本量的继续增加不再明显影响等位基因的检出数量。杂合度较低的位点随样本量的变化波动较大, 杂合度较高的位点随样本量的变化波动较小。

关键词: 群体遗传, STR, 等位基因, 样本量

Abstract:

In the genetic study, the samples can greatly influence the analysis and interpretation of the genetic data obtained. Here we examined the effects of sample size on the observed number of allele of 9 STR loci (D3S1358, vWA, FGA, TH01, TPOX, CSF1PO, D13S317, D5S818, D7S820) with 30 various population genetic data. The results show: the quantity of alleles and the quantity of samples was not obviously corresponding, while the populations with few samples had more allele observed. And there was no significant influence on the quantity of the allele observed when the quantity of the samples reached to a certain amount. H (heterozygosity) was up to a stable level when the quantity of sample was 50. Those who had low heterozygosity (such as TPOX) changed obviously with the quantity of samples, while those had high heterozygosity (such as FGA) changed a little with the quantity of samples.

高雅，李生斌. STR遗传多态性研究中样本数量对等位基因检出数量的影响[J]. 遗传, 2008, 30(3): 313-313―320.

GAO Ya, LI Sheng-Bin. Effects of sample size on the observed number of allele of 9 STR loci with various genetic data[J]. HEREDITAS, 2008, 30(3): 313-313―320.

[1]	王飞, 王萌, 张兴华, 宇克莉, 郑连斌, 杨亚军. 中国西南地区3个隔离人群遗传亚结构分析[J]. 遗传, 2022, 44(5): 424-431.
[2]	寇洁, 李严, 王鹏, 刘红, 刘佳文, 王涓, 王也, 张亮, 沈富军. 大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化[J]. 遗传, 2022, 44(3): 253-266.
[3]	杨慧杰, 李德, 白卉泠, 张铭, 黄俊, 袁小青. 一例ALMS1基因复合杂合突变所致的Alstrom综合征的诊疗和基因检测分析[J]. 遗传, 2022, 44(12): 1148-1157.
[4]	文子龙, 赵毅强. 群体遗传学下动物驯化研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(3): 226-239.
[5]	曹延延, 程苗苗, 宋昉, 瞿宇晋, 白晋丽, 金煜炜, 王红. 脊髓性肌萎缩症SMN1基因 2+0基因型携带者的家系研究[J]. 遗传, 2021, 43(2): 160-168.
[6]	刘志勇, 任贺, 陈冲, 张京晶, 张晓梦, 石妍, 石林玉, 陈滢, 程凤, 贾莉, 陈曼, 范庆炜, 张家榕, 李万婷, 王萌春, 任子林, 刘雅诚, 倪铭, 孙宏钰, 严江伟. 基于有限突变模型和大规模数据的19个常染色体STR的实际突变率研究[J]. 遗传, 2021, 43(10): 949-961.
[7]	王小娟, 钱恩芳, 李悦, 宋正阳, 赵慧, 谢何鑫, 李彩霞, 黄江, 江丽. 中国西南地区藏族人群遗传亚结构研究[J]. 遗传, 2020, 42(6): 565-576.
[8]	梅志超, 位竹君, 于佳慧, 冀凤丹, 解莉楠. 多组学关联分析揭示表观等位基因在拟南芥环境适应性进化中的作用及机制[J]. 遗传, 2020, 42(3): 321-331.
[9]	王燕超,马晓燕,孙筱放,冼嘉嘉,李少英,何文智,王晓蔓,黎青. Y染色体微缺失人群中Y-STR等位基因缺失模式分析[J]. 遗传, 2019, 41(3): 243-253.
[10]	胡健,周逸人,丁佳琳,王志远,刘凌,王业开,娄慧玲,乔守怡,吴燕华. ABO血型综合实验基因分型技术简化及其群体遗传分析拓展[J]. 遗传, 2017, 39(5): 423-429.
[11]	高峰, 李海鹏. 群体遗传学模拟软件应用现状[J]. 遗传, 2016, 38(8): 707-717.
[12]	王云生. 基于高通量测序的植物群体基因组学研究进展[J]. 遗传, 2016, 38(8): 688-699.
[13]	王春明. 本科遗传学教学中的遗传漂变概念探讨[J]. 遗传, 2016, 38(1): 82-89.
[14]	阮修艳, 王伟妮, 杨雅冉, 谢兵兵, 陈婧, 刘雅诚, 严江伟. 北京汉族群体39个短串联重复序列基因座多态性及其遗传关系[J]. 遗传, 2015, 37(7): 683-691.
[15]	邢万金, 莫日根. 遗传学教学中在细胞与分子水平上理解等位基因的显性与隐性[J]. 遗传, 2015, 37(1): 98-108.