鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选

doi:10.3724/SP.J.1005.2011.00262

遗传 ›› 2011, Vol. 33 ›› Issue (3): 262-269.doi: 10.3724/SP.J.1005.2011.00262

鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选

徐丽华^{1, 2}, 常玉梅¹, 刘春雷^{1, 2}, 梁利群¹, 刘金亮^{1, 2} , 池炳杰^{1, 2}

1. 中国水产科学院黑龙江水产研究所, 哈尔滨 150070 2. 上海海洋大学水产与生命学院, 上海 201306

收稿日期:2010-05-11 修回日期:2010-06-22 出版日期:2011-03-20 发布日期:2011-02-25
通讯作者: 梁利群 E-mail:lqliang@fishbreeding.org

Screening cold-acclimation differential expression candidate genes in the brain of common carp (Cyprinus carpio)

XU Li-Hua^{1, 2}, CHANG Yu-Mei¹, LIU Chun-Lei^{1, 2}, LIANG Li-Qun¹, LIU Jin-Liang^{1, 2}, CHI Bing-Jie^{1, 2}

1. Heilongjiang River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Harbin 150070, China 2. College of Fisheries and Life Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China

Received:2010-05-11 Revised:2010-06-22 Online:2011-03-20 Published:2011-02-25
Contact: LIANG Li-Qun E-mail:lqliang@fishbreeding.org

摘要/Abstract

摘要： 采用双标准曲线相对实时荧光定量PCR法, 分别以23℃常温对照组和6℃低温待测组的黑龙江鲤脑组织cDNA为模板, 以18S rRNA为内参基因, 检测26个候选基因的相对表达量。实验数据经显著性分析发现, 有5个候选基因在低温条件下表达量显著上升(P<0.01), 与对照组相比它们的表达量分别上升了2.11倍、13.9倍、2.52倍、7.38倍和1.83倍, 基因功能比对结果表明其编码蛋白产物分别是脂肪酸链延伸蛋白、酰基辅酶A脱氢酶、转录起始因子IIB、肌醇-1-磷酸合成酶、血脑屏障HT7抗原; 有7个候选基因在低温下表达量分别下降了21.8%、25.9%、16.6%、23.7%、15.8%、16.3%、42.5%, 但对照组和待测组差异不显著(P>0.05), 基因功能比对发现它们主要参与抑制糖酵解, 促进细胞凋亡和干扰神经系统的重塑活动。上述低温下表达量显著上升的5个冷诱导候选基因的获得为今后进行不耐低温鱼类的基因工程育种提供了基因元件。

关键词: 鲤, 脑组织cDNA, 低温, 双标准曲线法, 实时荧光定量PCR, 候选基因

徐丽华，常玉梅，刘春雷，梁利群，刘金亮，池炳杰. 鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选[J]. 遗传, 2011, 33(3): 262-269.

XU Li-Hua, CHANG Yu-Mei, LIU Chun-Lei, LIANG Li-Qun, LIU Jin-Liang, CHE Bing-Jie. Screening cold-acclimation differential expression candidate genes in the brain of common carp (Cyprinus carpio)[J]. HEREDITAS, 2011, 33(3): 262-269.

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鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选

Screening cold-acclimation differential expression candidate genes in the brain of common carp (Cyprinus carpio)

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