系统发育研究中“长枝吸引”现象概述
1.云南大学生物资源保护与利用重点实验室, 昆明 650091;
2.中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化实验室,昆明 650023
收稿日期: 2006-12-26
修回日期: 2007-02-09
网络出版日期: 2007-06-10
“Long Branch Attraction” Artifact in Phylogenetic Reconstruction
Received date: 2006-12-26
Revised date: 2007-02-09
Online published: 2007-06-10
系统发育研究(phylogeny)不仅有助于重建地球所有生物体的进化历史, 而且还可以揭示进化生物学领域中的一些基本问题。清晰了解各生物物种进化历程及不同物种之间的进化关系, 是进一步研究和探索生物学其他学科的基础。但是现今广泛应用的所有系统发育分析方法都存在一定的局限性, 在一定程度上不能有效消除各种误差, 从而不能客观地处理和分析数据, 也就不能成功重建生物进化历程, 真实反映物种进化关系。系统发育研究中, “长枝吸引” (Long-branch Attraction, LBA)假象是最为困扰研究者的问题。文章从“长枝吸引”问题的产生原由、检测方法以及消除策略等多个方面进行详尽概述, 并通过列举典型实例, 阐述了解决“长枝吸引”问题的途径。
黎一苇,于黎,张亚平 . 系统发育研究中“长枝吸引”现象概述[J]. 遗传, 2007 , 29(6) : 659 -667 . DOI: 10.1360/yc-007-0659
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