摘要： N⁶-甲基腺苷（m⁶A）是真核生物mRNA中最丰富的内部修饰，在基因表达调控中起关键作用。然而，传统的甲基转移酶敲除策略会改变全转录组的m⁶A水平，导致难以解析单个特定m⁶A位点的具体生物学功能。2025年12月31日，北京大学生命科学学院刘君与魏文胜课题组在Cell在线发表了题为“FOCAS: Transcriptome-wide screening of individual m6A sites functionally dissects epitranscriptomic control of gene expression in cancer”的研究论文（doi: 10.1016/j.cell.2025.11.037）。该研究开发了一种名为FOCAS（functional m⁶A sites detection by CRISPR-dCas13b-FTO screening）的新型筛选平台，实现了在全转录组水平对单个m⁶A位点进行高通量的功能鉴定。研究人员利用融合了去甲基化酶FTO的dCas13b系统，在4种人类癌细胞系中对数万个m⁶A位点进行了精准去甲基化筛选，鉴定出4,475个其修饰状态显著影响细胞适应性（fitness）的功能靶基因（FiGenes）。该研究不仅绘制了癌症中功能性m⁶A位点的高分辨率图谱，更揭示了m⁶A调控的复杂逻辑：（1）基因内位点功能的异质性，即同一基因内不同区域的m6A位点（对比mRNA外显子区与染色质相关RNA/carRNA区）可通过招募不同的阅读蛋白（如IGF2BP2或YTHDF2）发挥截然相反的调控作用；（2）顺式与反式调控机制，发现carRNA上的m⁶A位点常以反式作用（trans）调控基因表达；（3）表观转录-表观遗传串扰，研究深入解析了新型抑癌基因KCTD1，发现其受m⁶A调控并能进一步调节H3K4me3水平以重塑染色质状态。这项工作为从“位点特异性”角度理解m⁶A修饰提供了强有力的工具，突破了以往仅能研究整体修饰水平的局限，为开发基于RNA修饰的精准癌症疗法提供了新的靶点和理论依据。