鸡apoA5基因单核苷酸多态性及其与屠体性状的关联研究

doi:10.3724/SP.J.1005.2008.00607

遗传 ›› 2008, Vol. 30 ›› Issue (5): 607-612.doi: 10.3724/SP.J.1005.2008.00607

鸡apoA5基因单核苷酸多态性及其与屠体性状的关联研究

姚俊峰, 张莹, 吴桂琴, 郑江霞, 邓学梅, 杨宁

中国农业大学动物科技学院, 北京 100094

收稿日期:2007-10-18 修回日期:2008-01-30 出版日期:2008-05-10 发布日期:2008-05-10
通讯作者: 杨宁

Polymorphisms of chicken apoA5 gene and association with carcass traits of chickens

YAO Jun-Feng, ZHANG Ying, WU Gui-Qin, ZHENG Jiang-Xia, DENG Xue-Mei, YANG Ning

College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100094, China

Received:2007-10-18 Revised:2008-01-30 Online:2008-05-10 Published:2008-05-10
Contact: YANG Ning

摘要/Abstract

摘要：

以丝羽乌骨鸡和隐性白洛克正反交产生的F2代为实验群体, 采用PCR-SSCP和DNA测序的方法检测鸡载脂蛋白A5(apoA5)基因的单核苷酸多态性(SNPs), 并将所发现的SNPs与体重、胸肌重、腿肌重、心脏重、肝脏重和腹脂重等屠体性状进行关联分析。结果发现, 鸡apoA5基因5′-调控区C-169T, 外显子2 C600T、T635C, 外显子3 C841G、C914T、C1142G、C1394T共7个突变位点。其中外显子2突变位点C600T、T635C对12周龄腹脂重、腹脂率、肝脏重和心脏重有显著影响(P<0.05), 根据PCR-SSCP的结果将其分为6种基因型(AA, AB, AC, BB, BC, CC): 其中CC型个体的腹脂重和腹脂率显著高于AA型、AB型、AC型、BB型、BC型 (P<0.05); AC型个体的肝脏重显著低于AA型、AB型、BB型、BC型和CC型的肝脏重(P<0.05); BC型个体的心脏重显著低于BB型的心脏重(P<0.05)。

关键词: 鸡, PCR-SSCP, SNP, 屠体性状, 载脂蛋白A5基因

Abstract:

Seven single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified by PCR-SSCP and sequencing in the chicken apoA5 gene in F2 chickens from an experimental cross of White Plymouth Rock × Silkies. One SNP(C-169T) located on the 5′-regulatory region, another two in the second exon were transitions of C to T (600) and T to C (635). Four SNPs in the third exon were found, which were C841G, C914T, C1142G, C1394T. The association of the polymorphisms with carcass traits was investigated. The most significant results were yielded from primer apoA3F/R: the abdominal fat weight of CC chickens were significantly higher than that of AA, AB, AC, BB and BC chickens (P<0.05); AC chickens had lower liver weight than that of AA, AB, BB, BC and CC (P<0.05); BC chickens had lower heart weight than that of BB (P<0.05).

姚俊峰，张莹，吴桂琴，郑江霞，邓学梅，杨宁. 鸡apoA5基因单核苷酸多态性及其与屠体性状的关联研究[J]. 遗传, 2008, 30(5): 607-612.

YAO Jun-Feng, ZHANG Ying, WU Gui-Qin, ZHENG Jiang-Xia, DENG Xue-Mei, YANG Ning . Polymorphisms of chicken apoA5 gene and association with carcass traits of chickens[J]. HEREDITAS, 2008, 30(5): 607-612.

[1]	李智,何俊,蒋隽,Richard G. Tait Jr.,Stewart Bauck,过伟,吴晓林. 牛SNP芯片分型检出率和分型错误率对基因型填充准确率的影响[J]. 遗传, 2019, 41(7): 644-652.
[2]	陈家辉, 任学义, 李丽敏, 卢诗意, 程湉, 谭量天, 梁少东, 何丹林, 罗庆斌, 聂庆华, 张细权, 罗文. 转录组测序揭示细胞周期通路参与鸡腹脂沉积[J]. 遗传, 2019, 41(10): 962-973.
[3]	褚衍凯,靳艳飞,邢天宇,马广伟,崔婷婷,闫晓红,李辉,王宁. 鸡PPARγ基因转录本3上游开放阅读框转录后的调控作用[J]. 遗传, 2018, 40(8): 657-667.
[4]	何俊,钱长嵩,RichardG.TaitJr.,StewartBauck,吴晓林. SNP芯片数据估计动物个体基因组品种构成的方法及应用[J]. 遗传, 2018, 40(4): 305-314.
[5]	李敏,董翔宇,梁浩,冷丽,张慧,王守志,李辉,杜志强. 肉鸡腹脂率双向选择系群体表型数据库(NEAUHLFPD)的设计及其功能实现[J]. 遗传, 2017, 39(5): 430-437.
[6]	张潇飞,宋鹤,刘静,张文建,闫晓红,李辉,王宁. 鸡miR-17-92基因簇靶基因ZFPM2的鉴定及功能分析[J]. 遗传, 2017, 39(4): 333-345.
[7]	江丽,孙启凡,马泉,赵雯婷,刘京,赵蕾,季安全,李彩霞. 27-plex SNP种族推断方法的优化及验证[J]. 遗传, 2017, 39(2): 166-173.
[8]	李光奇, 孙从佼, 吴桂琴, 石凤英, 刘爱巧, 孙皓, 杨宁. 利用转录组测序筛选鸡蛋褐壳性状相关基因[J]. 遗传, 2017, 39(11): 1102-1111.
[9]	程敏, 张文建, 邢天宇, 闫晓红, 李玉茂, 李辉, 王宁. 鸡miR-17-92基因簇上游调控区功能分析[J]. 遗传, 2016, 38(8): 724-735.
[10]	杨盛智, 吴国艳, 龙梅, 邓雯文, 王红宁, 邹立扣. 鸡蛋生产链中沙门氏菌对抗生素及消毒剂的耐药性研究[J]. 遗传, 2016, 38(10): 948-956.
[11]	刘娟, 孙艳, 姜强, 杨春红, 黄金明, 李建斌, 侯明海, 仲跻峰, 王长法, 刘保申. INCENP基因功能性单倍型可调控启动子活性并影响公牛精液品质[J]. 遗传, 2016, 38(1): 62-71.
[12]	张涛, 王文浩, 张跟喜, 王金玉, 薛倩, 顾玉萍. 京海黄鸡体重性状全基因组关联分析[J]. 遗传, 2015, 37(8): 811-820.
[13]	钱旭丽, 曹新. 耳聋相关基因COCH的非同义单核苷酸多态性致聋表型预测[J]. 遗传, 2015, 37(7): 664-672.
[14]	马俊平, 杨犀, 律娜, 刘飞, 陈燕, 朱宝利. 鸡T细胞受体γ链基因位点重新测序和组装[J]. 遗传, 2015, 37(6): 568-574.
[15]	宋晓燕, 张德祥, 张文武, 季从亮, 张细权, 罗庆斌. 鸡3种组织中热应激相关基因的表达谱芯片分析[J]. 遗传, 2014, 36(8): 800-808.

鸡apoA5基因单核苷酸多态性及其与屠体性状的关联研究

Polymorphisms of chicken apoA5 gene and association with carcass traits of chickens

PDF (PC)

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics