鸭生长激素基因内含子2、3多态性分析

doi:10.1360/yc-007-0438

遗传 ›› 2007, Vol. 29 ›› Issue (4): 438-442.doi: 10.1360/yc-007-0438

鸭生长激素基因内含子2、3多态性分析

许盛海¹, 包文斌^1,2, 黄军¹, 程金花¹, 束婧婷¹, 陈国宏¹

1. 扬州大学动物科学与技术学院, 扬州 225009;
2. 安徽农业大学动物科技学院, 合肥 230036

收稿日期:2006-07-03 修回日期:2006-09-06 出版日期:2007-04-10 发布日期:2007-04-10
通讯作者: 陈国宏

Polymorphic analysis of intron 2 and 3 of growth hormone gene in duck

XU Sheng-Hai¹, BAO Wen-Bin^1,2, HUANG Jun¹, CHENG Jin-Hua¹, SHU Jing-Ting¹, CHEN Guo-Hong¹

1. College of Animal Science and Technology, Yangzhou University, Yangzhou 225009, China; 2. College of Animal Science and Technology, Anhui Agriculture University, Hefei 230036, China

Received:2006-07-03 Revised:2006-09-06 Online:2007-04-10 Published:2007-04-10
Contact: CHEN Guo-Hong1

摘要/Abstract

摘要：

根据鸭生长激素基因内含子2、3的序列设计5对引物,利用PCR-SSCP方法对北京鸭、西湖野鸭、金定鸭、山麻鸭、荆江鸭、绍兴鸭等6个鸭品种进行了单核苷酸多态性分析, 并检测其多态性。结果共发现8个突变位点, 其中内含子2有7个: 2593处C-T, 2770处G-A, 2813处T-A, 2829处C-A, 2894处C-T, 2896处T-C,3100处C-G; 内含子3有1个: 3270处A-G。统计结果显示, 这8个变异位点的基因型频率分布与品种有关, 在这些基因座的变异水平上, 北京鸭和绍兴鸭表现出了相当的品种保守性, 本研究所检测到的这些基因座可能与鸭的生产性能有关。

关键词: 单核苷酸多态性, 鸭, 生长激素基因

Abstract:

The single nucleotide polymorphism (SNP) of growth hormone gene was investigated in various breeds of duck, including Beijing ducks, Xihu mallards, Jinding ducks, Shan Partridge ducks, Jingjiang ducks and Shaoxing ducks. The primers for intron 2 and 3 in GH gene were designed based on the database of duck genomic sequence and the SNPs were detected by PCR-SSCP method. Eight SNPs were found among individuals within a breed, which were 2593(C-T), 2770(G-A), 2813(T-A), 2829(C-A), 2894(C-T), 2896(T-C), and 3100(C-G) in intron 2 and 3270(A-G) in intron 3. The analytic results showed that the frequencies of genotypes in different breeds were significantly different. Based on these SNPs, Beijing ducks and Shaoxing ducks represented their own unique conservativeness, indicating that these SNPs may have relationship with some productive traits of duck.

许盛海，包文斌，黄军，程金花，束婧婷，陈国宏. 鸭生长激素基因内含子2、3多态性分析[J]. 遗传, 2007, 29(4): 438-442.

XU Sheng-Hai, BAO Wen-Bin, HUANG Jun, CHENG Jin-Hua, SHU Jing-Ting, CHEN Guo-Hong. Polymorphic analysis of intron 2 and 3 of growth hormone gene in duck[J]. HEREDITAS, 2007, 29(4): 438-442.

[1]	李以格, 张丹丹. 后GWAS时代结直肠癌致病SNP功能机制的研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(3): 203-214.
[2]	王浩宇, 胡渝涵, 曹悦岩, 朱强, 黄雨果, 李茜, 张霁. 基于全基因组数据的AI-SNPs筛选及大陆次级区域内群体遗传结构差异研究[J]. 遗传, 2021, 43(10): 938-948.
[3]	王玉琢, 张一鸣, 董晓莲, 王学才, 朱建福, 王娜, 江峰, 陈跃, 姜庆五, 付朝伟. 2型糖尿病易感基因SNP位点对生活方式干预降低血糖应答效果的修饰效应[J]. 遗传, 2020, 42(5): 483-492.
[4]	梁文权,侯豫,赵存友. 精神分裂症相关单核苷酸多态性调控microRNA功能研究进展[J]. 遗传, 2019, 41(8): 677-685.
[5]	张晴,平杰,张昊翔,康波,李元丰,周钢桥. MKL1基因多态性与高原环境适应性的遗传关联研究[J]. 遗传, 2019, 41(7): 634-643.
[6]	彭哲也,唐紫珺,谢民主. 机器学习方法在基因交互作用探测中的研究进展[J]. 遗传, 2018, 40(3): 218-226.
[7]	刘莉莉, 郭爱伟, 吴培福, 陈粉粉, 杨亚晋, 张勤. 敲降VPS28基因对中国荷斯坦奶牛乳脂合成的调控[J]. 遗传, 2018, 40(12): 1092-1100.
[8]	杨熳,卢冰婕,段媛媛,陈晓峰,马建岗,郭燕. 骨质疏松症易感基因BDNF的遗传学关联分析及功能研究[J]. 遗传, 2017, 39(8): 726-736.
[9]	张统雨,朱才业,杜立新,赵福平. 羊重要性状全基因组关联分析研究进展[J]. 遗传, 2017, 39(6): 491-500.
[10]	弓弦,张超,伊利亚斯·艾萨,时瑛,杨雪唯,努尔斯曼古丽奥斯曼,关亚群,徐书华. 2型糖尿病易感候选基因在世界不同人群中的多样性比较分析[J]. 遗传, 2016, 38(6): 543-559.
[11]	宋庆峰, 张红星, 马亦龙, 周钢桥. 复杂疾病的遗传易感基因区域的精细定位[J]. 遗传, 2014, 36(1): 2-10.
[12]	李骞刘舒媛林克勤孙浩于亮黄小琴褚嘉祐杨昭庆. EGLN1基因6个单核苷酸多态性与高海拔低氧适应的相关性[J]. 遗传, 2013, 35(8): 992-998.
[13]	夏正龙俞菊华李红霞李建林唐永凯任洪涛朱双宁. 建鲤肠型脂肪酸结合蛋白基因的分离及其SNPs与增重的相关分析[J]. 遗传, 2013, 35(5): 628-636.
[14]	马晓军，郭浩辉，郝绍文，孙首选，杨小春，余博，金群华. 宁夏回族原发性膝骨性关节炎与瘦素受体基因多态性的相关性[J]. 遗传, 2013, 35(3): 359-364.
[15]	杨应忠王亚平马兰杜洋格日力. 中国汉族高原肺水肿易感基因的全基因组关联研究[J]. 遗传, 2013, 35(11): 1291-1299.

鸭生长激素基因内含子2、3多态性分析

Polymorphic analysis of intron 2 and 3 of growth hormone gene in duck

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