基于科教融合培养大学生拔尖创新能力的表观遗传学综合实验课程

doi:10.16288/j.yczz.23-179

遗传 ›› 2023, Vol. 45 ›› Issue (12): 1158-1168.doi: 10.16288/j.yczz.23-179

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基于科教融合培养大学生拔尖创新能力的表观遗传学综合实验课程

欧秀芳(), 吴莹, 李宁, 姜丽丽, 刘宝, 宫磊()

东北师范大学，分子表观遗传学教育部重点实验室，长春 130024

收稿日期:2023-07-03 修回日期:2023-11-15 出版日期:2023-12-20 发布日期:2023-11-16
通讯作者: 宫磊 E-mail:ouxf074@nenu.edu.cn;gongl100@nenu.edu.cn
作者简介:欧秀芳，博士，副教授，研究方向：表观遗传学。E-mail: ouxf074@nenu.edu.cn
基金资助:
吉林省高等教育教改研究课题立项(JLO4169120190727102937);吉林省高等教育教改研究课题立项(JLJY202393805644);吉林省高等教育教改研究课题立项(JG2020008)

Epigenetics comprehensive experimental course based on the integration of science and education to cultivate students' ability of cutting-edge innovation

Xiufang Ou(), Ying Wu, Ning Li, Lili Jiang, Bao Liu, Lei Gong()

Key Laboratory of Molecular Epigenetics of Ministry of Education (MOE), Northeast Normal University, Changchun 130024, China

Received:2023-07-03 Revised:2023-11-15 Published:2023-12-20 Online:2023-11-16
Contact: Lei Gong E-mail:ouxf074@nenu.edu.cn;gongl100@nenu.edu.cn
Supported by:
Higher Education Teaching Reform Research Topic of Jilin Province(JLO4169120190727102937);Higher Education Teaching Reform Research Topic of Jilin Province(JLJY202393805644);Higher Education Teaching Reform Research Topic of Jilin Province(JG2020008)

摘要/Abstract

摘要：

科教融合是高校培养拔尖创新人才的有效途径。表观遗传学是对经典遗传学的拓展，针对本校拔尖人才培养体系中表观遗传学实验内容的缺失，我们首次进行了表观遗传学科教融合、协同育人的尝试，将本实验室前期在水稻中开展的OsMET1-2基因的研究成果进行实验教学转化，建成了一个集前沿性、研究型和创新性为一体，以学生独立实验为中心，考核方式多元化的表观遗传学综合实验课程。本课程以OsMET1-2基因突变体和野生型为实验材料，将表观遗传上游酶促基因突变与基因组内特定位点的DNA甲基化和基因组稳定性联系起来。通过本课程的实践，学生对表观遗传修饰的重要作用有了更深刻理解，科研能力得到极大提升，强力支撑了本专业拔尖创新人才的培养。

关键词: 科教融合, 表观遗传学综合实验, 实验教学

Abstract:

The integration of science and education is an effective way for universities to cultivate students in cutting-edge innovative interests. Epigenetics is the expansion of classical genetics, the corresponding experimental courses of which have not been integrated into the current teaching system. In this paper, by taking advantage of our laboratory's research on the DNA methylation maintenance gene, OsMET1-2 in rice, we have integrated our innovative findings in the education curriculum, and built a comprehensive teaching system on experimentation research, which greatly stimulates the curiosity of the students. Taking the OsMET1-2 mutants and its isogenic wild-type rice plants as experimental materials, this course has successfully demonstrated a causal link between genetic mutation and epigenetic variation, a topic widely interested by the students in learning genetics and epigenetics. Through the practice of this course, students have a deeper understanding of the important role of epigenetic modifications, their scientific research capabilities have been greatly improved, thereby strongly supporting the cultivation of top innovative talents among the students.

Key words: integration of science and education, epigenetics comprehensive experiment, experimental education

欧秀芳, 吴莹, 李宁, 姜丽丽, 刘宝, 宫磊. 基于科教融合培养大学生拔尖创新能力的表观遗传学综合实验课程[J]. 遗传, 2023, 45(12): 1158-1168.

Xiufang Ou, Ying Wu, Ning Li, Lili Jiang, Bao Liu, Lei Gong. Epigenetics comprehensive experimental course based on the integration of science and education to cultivate students' ability of cutting-edge innovation[J]. Hereditas(Beijing), 2023, 45(12): 1158-1168.

图/表 7

表1

图1

图2

图3

表2

课程评价方式"

评价方式	具体要求	考核目的	评价标准	比例
研究综述	学生独立查阅文献，撰写植物中关于DNA甲基化研究方法和转座子研究方法的综述	考察学生自主学习、查阅文献并进行归纳和总结的能力，提高学生撰写综述规范性和科学性的能力	思路是否清晰，逻辑是否严谨，论证是否充分(25分)；文献资料是否详实，是否具有代表性(25分)；文字表达是否准确、流畅，是否符合学术道德规范(25分)；是否运用了本门课程相关理论知识，是否体现了科学研究能力(25分)	20%
实验设计	学生以小组为单位进行实验设计和汇报	考察学生提出科学问题、分析问题和解决问题的能力，提高学生团队协作的能力	实验设计是否清晰、完整，具有科学性(60分)；设计中遇到的问题是否能够自主解决(15分)；组内是否具有明确的分工(10分)；汇报中是否能够准确回答教师问题(15分)	20%
实验操作	学生独立或与小组成员合作完成实验过程，实验仪器使用规范	考察学生实验操作的规范性，以及在实验过程中对遇到的问题进行分析和解决的能力，提高学生的实践能力和高阶科研思维	实验前的准备是否充分(10分)；实验仪器使用是否规范(60分)；实验操作时小组分工是够明确(15分)；实验过程中遇到的问题是否能够有效解决(15分)	20%
实验记录	学生要有完整且清晰的手写实验记录	考察学生实验记录的科学性和完整性，提高学生的基本科研素养	是否及时记录实验过程(30分)；实验记录是否清晰、完整(60分)；是否体现了实验中的反思(10分)	10%
研究论文	学生按照学术论文要求撰写研究论文	考察学生撰写学术论文的规范性和科学性，提高学生针对实验结果和实验中的问题进行分析和讨论的能力	研究论文的格式是否规范(25分)；逻辑是否清晰(25分)；研究方法和结果是否可信(25分)；是否对实验结果进行了深入的分析和讨论(25分)	30%

表2

表3

图4

参考文献 29

[1]	Hu LJ, Li N, Xu CM, Zhong SL, Lin XY, Yang JJ, Zhou TQ, Yuliang AZ, Wu Y, Chen YR, Cao XF, Zemach A, Rustgi S, von Wettstein D, Liu B. Mutation of a major CG methylase in rice causes genome-wide hypomethylation, dysregulated genome expression, and seedling lethality. Proc Natl Acad Sci USA, 2014, 111(29): 10642-10647. doi: 10.1073/pnas.1410761111 pmid: 25002488
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组织形式	具体内容	学时
课前理论部分	1. 教师介绍本课程相关的研究背景，引导学生提出科学问题(2学时) 2. 教师对相关技术进行介绍，包括引物设计软件使用方法和引物设计原则，转座子激活检测相关知识，基因组重测序原理以及DNA甲基化检测相关知识(2学时)	4
实验设计汇报	1. 课后学生以小组为单位进行实验设计 2. 课上学生进行实验设计汇报，师生共同探讨提出修改建议，确定小组特异的实验方案(按照10组，每组15~20分钟计算，约4学时)	4
实验一：水稻DNA的提取及浓度检测	1. 实验操作过程中注意事项的讲解(1学时) 2. DNA的提取(3.5学时) 3. DNA浓度的检测(1.5学时)	6
实验二：实验材料基因型的鉴定	1. 实验操作过程中注意事项的讲解(0.5学时) 2. PCR扩增(1.5学时) 3. 琼脂糖凝胶电泳(1.5学时)	3.5
实验三：转座子激活检测	1. 实验操作过程中注意事项的讲解(0.5学时) 2. PCR扩增(1.5学时) 3. 琼脂糖凝胶电泳(1.5学时)	3.5
实验四： DNA甲基化检测和变异分析	1. 实验操作过程中注意事项的讲解(1学时) 2. 亚硫酸盐处理和产物回收、连接、转化(10学时) 3. 阳性克隆筛选、测序(2学时) 4. 测序数据分析计算DNA甲基化水平(2学时)	15

主观性问题	满意度(%)
主观性问题	2020春 (43人)	2021春 (43人)	2022春 (35人)	2022秋 (33人)
1. 本实验内容的设置突出了研究型的教学内容	97.67	97.67	100	93.94
2. 课前教师对背景的简单介绍有助于您更深刻的了解本实验所要解决的生物学问题	95.35	100	97.14	100
3. 自主查阅文献并完成实验相关研究方法综述能够培养科研思维中的前期调研	95.35	100	97.14	100
4. 以小组为单位进行实验设计有助于培养自主思考能力	97.67	100	94.29	100
5. 小组内平行实验的设计可明确科研中需要的生物学重复和技术重复问题	97.67	100	97.14	100
6. 整体实验的设置体现了以你们为主导的实验过程	100	97.67	97.14	96.97
7. 本实验充分调动了你们主动思考和主动解决问题的能力	100	97.67	97.14	96.97
8. 在整个教学中，您认为评价方式很合理	100	100	97.14	93.94
9. 考核方式的多元性有助于你们更加注重实验过程的严谨和实验思维的培养	97.67	100	94.28	100
10. 您愿意继续采用这种方式进行学习	100	100	85.72	93.94
11. 您觉得这种学习方式能够有效培养你的科研思维和创新能力	97.67	100	91.43	100
12. 实验课的学习过程让您很感兴趣、具有挑战性，并积极完成作业	100	95.35	91.43	84.85
13. 通过实验课这种学习方式，您对自己掌握知识的程度很满意	100	100	85.71	90.91
14. 通过小组合作设计实验方案的方式能够增进您和同学的交流和共同进步	97.67	100	91.43	93.94
15. 您觉得在此学习过程中没有给你增加课业负担	88.37	79.07	65.71	66.67

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