• 研究报告 •
李轲,周晓蓉,朱东丽,陈晓峰,郭燕
Ke Li, Xiaorong Zhou, Dongli Zhu, Xiaofeng Chen, Yan Guo
Biomedical Informatics & Genomics Center, Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology, Xi'an Jiaotong University, Xi'an 710049, China
摘要: 系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)是一种累及多器官的自身免疫性疾病。8p23区域的FAM167A-BLK基因座是SLE既往全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)报道的热点区域。为探索该区域内功能SNP(single-nucleotide polymorphism)对其相关基因BLK和FAM167A调控的作用,本研究利用GCTA软件和fnGWAS进行一系列功能注释,筛选出潜在的功能SNP,并通过双荧光素酶报告基因实验、shRNA敲低和CRISPR/dCas9敲低等功能实验进行验证。结果显示,该区域有4个功能SNP对BLK表达具有等位基因特异性增强效应,但对FAM167A无显著影响。同时,BLK可调控FAM167A表达。FAM167A可能是SLE的潜在致病基因。本研究深化了对FAM167A-BLK区域的遗传变异调控机制的理解,为解析SLE的发生机制研究提供了新视角。