几种全长cDNA文库构建方法比较

遗传 ›› 2006, Vol. 28 ›› Issue (7): 865-873.

几种全长cDNA文库构建方法比较

毛新国，景蕊莲，孔秀英，赵光耀，贾继增

中国农业科学院作物科学研究所，农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程，农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,北京100081

收稿日期:2005-07-05 修回日期:2005-08-11 出版日期:2006-07-10 发布日期:2006-07-10
通讯作者:
贾继增

Compare of Full-length cDNA Library Construction Methods

MAO Xin-Guo, JING Rui-Lian, KONG Xiu-Ying, ZHAO Guang-Yao, JIA Ji-Zeng

National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement, Key Laboratory of Crop Germplasm & Biotechnology/the Ministry of Agriculture, Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China

Received:2005-07-05 Revised:2005-08-11 Online:2006-07-10 Published:2006-07-10
Contact: JIA Ji-Zeng

摘要/Abstract

摘要： 全长cDNA文库是高效、大规模获得基因全序列信息的一条有效途径，尤其是对基因组庞大，近期内尚不能进行全基因组测序的生物来说，是一条开展功能基因组研究的重要途径。本文对几种全长cDNA文库的构建方法进行了概述，针对各种方法的原理及优缺点做了分析、比较，并结合本实验室的结果，重点介绍了Cap-trapper法在小麦全长cDNA文库中的应用及文库中全长基因比例判定方法。

关键词: 全长cDNA文库, SMART法, Oligo-cap法, Cap-jumping法, Cap-trapper法

Abstract: Full-length cDNA library is the cornerstone to find new genes in high-throughput manner, especially in huge genome organisms that cannot carry out whole genome sequencing. In this review, the authors compared the theories and characters of several cDNA construction methods, and introduced Cap-trapper method and standard to judge full-length cDNA in detail according to the utilization of this method in wheat full-length cDNA construction.

中图分类号:

毛新国，景蕊莲，孔秀英，赵光耀，贾继增. 几种全长cDNA文库构建方法比较[J]. 遗传, 2006, 28(7): 865-873.

MAO Xin-Guo, JING Rui-Lian, KONG Xiu-Ying, ZHAO Guang-Yao, JIA Ji-Zeng. Compare of Full-length cDNA Library Construction Methods[J]. HEREDITAS, 2006, 28(7): 865-873.

[1]	夏天，肖丙秀，郭俊明. 长链非编码RNA的作用机制及其研究方法[J]. 遗传, 2013, 35(3): 269-280.
[2]	亓合媛，张昭军，李雅娟，方向东. 染色质构象调控真核基因的表达[J]. 遗传, 2011, 33(12): 1291-1299.
[3]	王，霞，孙丹凤，房静远. mTOR信号途径与表观遗传关系的研究进展[J]. 遗传, 2006, 28(12): 1585-1585~1590.
[4]	周丽伟，马飞，李庆伟. 激肽原基因的选择性剪接与功能研究进展[J]. 遗传, 2006, 28(12): 1649-1649~1655.
[5]	刘忠渊，王芸，吕国栋，王贤磊，张富春，马纪. Tenebrio molitor抗冻蛋白基因家族cDNA片段的克隆、序列分析及原核表达[J]. 遗传, 2006, 28(12): 1532-1532~1540.
[6]	许德晖，黄辰，刘利英，宋土生. 高效siRNA设计的研究进展[J]. 遗传, 2006, 28(11): 1457-1461.
[7]	田春艳，张令强，贺福初. KRAB型锌指蛋白(KZNF)的研究进展[J]. 遗传, 2006, 28(11): 1451-1456.
[8]	张菁晶，冯，晶，朱英国，李阳生，. 全基因组预测目标基因的新方法及其应用[J]. 遗传, 2006, 28(10): 1299-1306.
[9]	王慧娟，张志敏，刘中来，熊国梅. 从细胞色素b基因序列差异分析神农架白熊的系统进化关系[J]. 遗传, 2006, 28(10): 1237-1264.
[10]	朱贵明，陈宏，卢建申，周艳荣，吴晓洁，陈红星，邓继先. 应用PCR-酶切连接法合成全长sFat1基因[J]. 遗传, 2006, 28(9): 1123-1128.
[11]	杨利平，周爱冬，李红，张文峰，吴艳阳，张健，韩梅. 人TNFAIP1基因克隆及其在常见细胞系中的表达[J]. 遗传, 2006, 28(8): 918-922.
[12]	宋雪梅，燕飞，杜立新. RNA诱导沉默复合体中的生物大分子及其装配[J]. 遗传, 2006, 28(6): 761-766.
[13]	张志敏，王慧娟，刘中来，熊国梅. 粪便取样对亚洲黑熊脑源性神经营养因子基因全长序列分析[J]. 遗传, 2006, 28(6): 665-671.
[14]	祁小廷，柴小清，刘靖，柴团耀. 改造地高辛标记DNA和检测试剂盒用于凝胶阻滞实验的新方法[J]. 遗传, 2006, 28(6): 721-725.
[15]	刘博，苏乔，汤敏谦，袁晓东，安利佳. 应用于染色体步移的PCR扩增技术的研究进展[J]. 遗传, 2006, 28(5): 587-595.