遗传 ›› 2026, Vol. 48 ›› Issue (9): 878-891.doi: 10.16288/j.yczz.25-241
陈智1,2(
), 冯耀森2, 许惠2, 孟庆振2, 张驰2, 康克莱2, 童诗雨2,3, 张哲2, 叶健1,2(
), 王乐1,2(
)
收稿日期:2025-12-13
修回日期:2026-02-14
出版日期:2026-09-20
发布日期:2026-03-20
通讯作者:
叶健,博士,主任法医师,研究方向:法医遗传学。E-mail: yejian77@126.com;作者简介:陈智,硕士研究生,专业方向:法医遗传学。E-mail: 530782935@qq.com
基金资助:
Zhi Chen1,2(
), Yaosen Feng2, Hui Xu2, Qingzhen Meng2, Chi Zhang2, Kelai Kang2, Shiyu Tong2,3, Zhe Zhang2, Jian Ye1,2(
), Le Wang1,2(
)
Received:2025-12-13
Revised:2026-02-14
Published:2026-09-20
Online:2026-03-20
Supported by:摘要:
法医DNA技术是亲缘关系鉴定的首选方法,然而已有标准方法可准确鉴定的亲缘关系范围仍存在一定局限,我国自主研发的二代测序技术装备有望提升法医DNA亲缘关系鉴定能力。本研究联合使用STRSeqTyper122二代测序STR分型试剂盒和FASTASeq 300二代测序仪对107份真实亲缘关系样本的63个常染色体STR基因座、42个Y-STR基因座和16个X-STR基因座以及1个性别判断基因座Amel进行检测。这些样本共计包含了113对亲子、48对全同胞、76对叔侄、66对祖孙、4对半同胞等不同的亲缘关系,结合模拟数据,应用ITO法基于常染色体STR基因座的长度多态性与序列多态性分型,计算不同等级亲缘关系的累积亲缘指数,系统评估该体系在亲缘关系鉴定中的实际应用效能。结果显示,以log10CLR值4和−4为阈值,在真实亲子关系和全同胞关系鉴定中的系统效能为100%;在二级亲缘关系鉴定中,基于模拟数据长度多态性的系统效能为55.2%,序列多态性的系统效能达75.11%,基于真实样本长度多态性的系统效能为54.45%,序列多态性的系统效能达76.71%。本研究结果表明,STRSeqTyper122试剂盒在一级亲缘关系鉴定中具有重要价值,基于序列多态性可使二级亲缘关系鉴定效能提升至75%以上。
陈智, 冯耀森, 许惠, 孟庆振, 张驰, 康克莱, 童诗雨, 张哲, 叶健, 王乐. STRSeqTyper122试剂盒和FASTASeq 300二代测序仪在亲缘关系鉴定中的应用效能评估[J]. 遗传, 2026, 48(9): 878-891.
Zhi Chen, Yaosen Feng, Hui Xu, Qingzhen Meng, Chi Zhang, Kelai Kang, Shiyu Tong, Zhe Zhang, Jian Ye, Le Wang. Application efficacy evaluation of the STRSeqTyper122 kit and the FASTASeq 300 second generation sequencer in kinship identification[J]. Hereditas(Beijing), 2026, 48(9): 878-891.
表2
使用62个常染色体STR基因座模拟成对二级亲缘关系鉴定的参数"
| 识别(与无关个体) | t1 | t2 | 灵敏度 | 特异性 | 阳性预测值 | 阴性预测值 | 系统效能 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 二级亲缘关系(长度) | 1 | -1 | 0.9537 | 0.9547 | 0.9960 | 0.9962 | 0.9579 |
| 2 | -2 | 0.8854 | 0.8712 | 0.9992 | 0.9999 | 0.8787 | |
| 3 | -3 | 0.7674 | 0.7214 | 0.9999 | 1.0000 | 0.7445 | |
| 4 | -4 | 0.5930 | 0.5110 | 1.0000 | 1.0000 | 0.5520 | |
| 二级亲缘关系(序列) | 1 | -1 | 0.9807 | 0.9816 | 0.9992 | 0.9983 | 0.9824 |
| 2 | -2 | 0.9499 | 0.9425 | 1.0000 | 0.9999 | 0.9463 | |
| 3 | -3 | 0.8928 | 0.8597 | 1.0000 | 1.0000 | 0.8763 | |
| 4 | -4 | 0.7917 | 0.7105 | 1.0000 | 1.0000 | 0.7511 |
表3
使用62个常染色体STR基因座检验真实二级亲缘关系的参数"
| 识别(与无关个体) | t1 | t2 | 灵敏度 | 特异性 | 阳性预测值 | 阴性预测值 | 系统效能 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 二级亲缘关系(长度) | 1 | -1 | 0.9589 | 0.9658 | 1.0000 | 0.9860 | 0.9692 |
| 2 | -2 | 0.8630 | 0.8288 | 1.0000 | 0.9918 | 0.8493 | |
| 3 | -3 | 0.7260 | 0.6712 | 1.0000 | 1.0000 | 0.6986 | |
| 4 | -4 | 0.6096 | 0.4795 | 1.0000 | 1.0000 | 0.5445 | |
| 二级亲缘关系(序列) | 1 | -1 | 0.9795 | 0.9863 | 1.0000 | 0.9863 | 0.9897 |
| 2 | -2 | 0.9452 | 0.9452 | 1.0000 | 0.9928 | 0.9486 | |
| 3 | -3 | 0.9110 | 0.8356 | 1.0000 | 1.0000 | 0.8733 | |
| 4 | -4 | 0.8425 | 0.6918 | 1.0000 | 1.0000 | 0.7671 |
图7
基于62个常染色体STR基因座不同等级亲缘关系间的log10CLR结果分布 A:基于长度多态性计算亲子和全同胞的log10CLR 亲子-全同胞值分布图;B:基于序列多态性计算亲子和全同胞的log10CLR 亲子-全同胞值分布图。C:基于长度多态性计算亲子关系和二级亲缘关系的log10CLR 亲子-二级值分布图。D:基于序列多态性计算亲子关系与二级亲缘关系的log10CLR 亲子-二级值分布图。E:基于长度多态性计算全同胞和二级亲缘关系log10CLR 全同胞-二级的分布图;F:基于序列多态性信息计算全同胞与二级亲缘关系log10CLR全同胞-二级的分布图。虚线表示判断阈值4和-4的位置。"
表4
基于62个常染色体STR基因座的长度多态性区分不同真实亲缘关系的参数"
| 区分亲缘关系 | t1 | t2 | 灵敏度 | 特异性 | 阳性预测值 | 阴性预测值 | 系统效能 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 亲子-全同胞(n=161) | 1 | -1 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 |
| 2 | -2 | 0.9912 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.9938 | |
| 3 | -3 | 0.9735 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.9814 | |
| 4 | -4 | 0.8584 | 0.9792 | 1.0000 | 1.0000 | 0.8944 | |
| 亲子-二级(n=259) | 1 | -1 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 |
| 2 | -2 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 3 | -3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 4 | -4 | 0.9912 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.9961 | |
| 全同胞-二级(n=194) | 1 | -1 | 0.9792 | 0.9726 | 0.9792 | 1.0000 | 0.9794 |
| 2 | -2 | 0.9375 | 0.8973 | 0.9783 | 1.0000 | 0.9124 | |
| 3 | -3 | 0.8542 | 0.8014 | 1.0000 | 1.0000 | 0.8144 | |
| 4 | -4 | 0.7500 | 0.6233 | 1.0000 | 1.0000 | 0.6546 |
表5
基于62个常染色体STR基因座的序列多态性区分不同真实亲缘关系的参数"
| 亲缘关系 | t1 | t2 | 灵敏度 | 特异性 | 阳性预测值 | 阴性预测值 | 系统效能 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 亲子-全同胞(n=161) | 1 | -1 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 |
| 2 | -2 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 3 | -3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 4 | -4 | 0.9646 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 0.9752 | |
| 亲子-二级(n=259) | 1 | -1 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 |
| 2 | -2 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 3 | -3 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 4 | -4 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | 1.0000 | |
| 全同胞-二级(n=194) | 1 | -1 | 0.9583 | 0.9521 | 0.9787 | 1.0000 | 0.9588 |
| 2 | -2 | 0.9375 | 0.9384 | 1.0000 | 1.0000 | 0.9381 | |
| 3 | -3 | 0.8958 | 0.8151 | 1.0000 | 1.0000 | 0.8351 | |
| 4 | -4 | 0.8333 | 0.7055 | 1.0000 | 1.0000 | 0.7371 |
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