Hrp NCSDS001基因克隆及其表达产物诱导拟南芥基因表达谱变化的研究

doi:10.1360/yc-007-0629

遗传 ›› 2007, Vol. 29 ›› Issue (5): 629-629―636.doi: 10.1360/yc-007-0629

Hrp N_CSDS001基因克隆及其表达产物诱导拟南芥基因表达谱变化的研究

张珏^1,3, 曹茂林², 黄玉碧^1,3, 吴伯骥²

1. 四川农业大学玉米研究所, 雅安 625014;
2. 中国科学院成都生物研究所, 成都 610041;
3. 四川农业大学教育部作物基因资源与遗传改良重点实验室, 雅安 625014

收稿日期:2006-07-04 修回日期:2006-12-05 出版日期:2007-05-08 发布日期:2007-05-08
通讯作者: 吴伯骥

Study of hrpN_CSDS001 and the gene expression profile of Arabidopsis thaliana induced by Harpin_CSDS001

ZHANG Jue^1,3, CAO Mao-Lin², HUANG Yu-Bi^1,3, WU Bo-Ji²

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Received:2006-07-04 Revised:2006-12-05 Online:2007-05-08 Published:2007-05-08
Contact: WU Bo-Ji

摘要/Abstract

摘要：

Erwinia carotovora subsp. carotovora CSDS001菌株具有可直接诱导烟草过敏反应特征, 从构建的CSDS001菌株基因组文库, 鉴定、克隆到hrpN_CSDS001基因, GenBank登录号AY939927; 构建的重组hrpN_CSDS001基因工程菌株经IPTG诱导培养, 获得的高效表达Harpin_CSDS001蛋白, 可诱导烟草发生过敏反应。30 mg/mL Harpin_CSDS001蛋白喷施拟南芥后, 分析第3 h、12 h、24 h、36 h和48 h拟南芥全基因谱表达动态变化, 结果显示发生显著表达差异(log ratio≤-1或≥1)的基因数分别为912、1787、2393、1833和1755。对被诱导发生显著表达差异的转录因子基因分析表明, 有13个转录因子家族: ZIM、BES1、TCP、C2C2、AP2/EREBP、WRKY、bHLH、bZIP、GARP、MYB、NAC、HB、C2H2与Harpin_CSDS001蛋白作用相关, 这些转录因子家族主要参与调控植物抗性、光合作用、生长发育、开花等相关功能基因表达。

关键词: hrpNCSDS001, HarpinCSDS001蛋白, 基因芯片分析, 克隆

Abstract:

Erwinia carotovora subsp. carotovora CSDS001 elicits hypersensitive reaction (HR) in tobacco. From the genomic libraries of Erwinia carotovora subsp. carotovora CSDS001, the hrpN_CSDS001 gene (Genebank number AY939927), was isolated. The hrpN_CSDS001 fusion protein was produced in Escherichia coli, and was used to induce HR by injecting into tobacco. We further examined the global regulation of Arabidopsis thaliana genes in response to Harpin_CSDS001 at a concentration of 30 mg/mL. We indicated that 912、1787、2393、1833 and 1,755 genes that were regulated significantly (log ratio ≤-1 or ≥1) at 3 h、12 h、24 h、36 h and 48 h respectively after the treatment. Analysis of some transcription factors (TF) showed that 13 TF families responded to Harpin_CSDS001including ZIM、BES1、TCP、C2C2、AP2/EREBP、WRKY、

bHLH、bZIP、GARP、MYB、NAC、HB、C2H2. These families mainly function in biological processes of plant defense、photosynthesis、development and flowering.

张珏，曹茂林，黄玉碧，吴伯骥. Hrp N_CSDS001基因克隆及其表达产物诱导拟南芥基因表达谱变化的研究[J]. 遗传, 2007, 29(5): 629-629―636.

ZHANG Jue, CAO Mao-Lin, HUANG Yu-Bi, WU Bo-Ji. Study of hrpN_CSDS001 and the gene expression profile of Arabidopsis thaliana induced by Harpin_CSDS001[J]. HEREDITAS, 2007, 29(5): 629-629―636.

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