检测绵羊BMPR-IB基因多态性寡核苷酸芯片的制备

doi:10.1360/yc-007-0957

遗传 ›› 2007, Vol. 29 ›› Issue (8): 957-962.doi: 10.1360/yc-007-0957

检测绵羊BMPR-IB基因多态性寡核苷酸芯片的制备

杨华^1,2，钟发刚²，王新华²，刘守仁²，朱滨³，邢军芬³，孙悦³

1. 石河子大学动物科技学院, 新疆石河子 832003;

2. 新疆农垦科学院兵团绵羊繁育生物技术重点实验室, 新疆石河子 832000;

3. 上海百傲科技有限公司, 上海 200233

收稿日期:2006-11-28 修回日期:2007-02-05 出版日期:2007-08-10 发布日期:2007-08-10
通讯作者: 刘守仁

The preparation of oligonucleotide chips for detecting BMPR-IB gene polymorphism in sheep

YANG Hua^1,2, ZHONG Fa-Gang², WANG Xin-Hua², LIU Shou-Ren², ZHU Bin³, XING Jun-Fen³, SUN Yue³

1. College of Animal Science & Technology, Shihezi University, Shihezi 832003, China;
2. Key Laboratory of Sheep Breed & Biotechnology of Xinjiang Bingtuan, Shihezi 832000, China;
3. Shanghai Baio Science and Technology Limited Company, Shanghai 200233, China

Received:2006-11-28 Revised:2007-02-05 Online:2007-08-10 Published:2007-08-10
Contact: LIU Shou-Ren

摘要/Abstract

摘要： FecB基因是控制中国美利奴羊排卵率和产羔数的主效基因，由于A746G的点突变而导致绵羊表型的变化。本研究的目的在于根据FecB基因的多态性，制备寡核苷酸芯片检测绵羊FecB基因的单核苷酸多态性（SNP），设计六条特异性的探针，用基因芯片点样仪将探针点样到醛基修饰的载玻片上，采集绵羊的血液样本，在芯片反应舱中，检测FecB基因A746G点突变，设计对应的软件进行判读，分析检测结果，与PCR-RFLP检测结果完全符合，证明制备的寡核苷酸芯片可以并行、准确而高效地检测FecB基因的多态性，能够作为分子标记辅助选育多胎绵羊的一种合适的检测技术。

关键词: 寡核苷酸芯片, BMPR-IB 基因, 基因多态性, 中国美利奴羊

Abstract:

BMPR-IB gene increases ovulation rate and litter size as a major gene in Chinese Merino, because of 746 A to G mutation. The aim of this study was to make oligonucleotide chips to determine single nucleotide polymorphism (SNP) in BMPR-IB gene. The oligonucleotide chips were manufactured by using six sequence-specific oligonucleotide probes derived from polymorphic regions in the mutation and spotting the probes by microarrayer onto the aldehyde modified glass slides. The 746 A to G mutation was detected with ovine blood in reaction cells of chips. The results were identified by designed the Arraydoctor 2.0 software, in accordance with those of restriction fragment length polymorphisms (RFLP). The results showed the oligonucleotide chips are a parallel, accurate and effective way for screening prolificacy in molecu-lar-assisted selection(MAS)of sheep.

杨华，钟发刚，王新华，刘守仁，朱滨，邢军芬，孙悦. 检测绵羊BMPR-IB基因多态性寡核苷酸芯片的制备[J]. 遗传, 2007, 29(8): 957-962.

YANG Hua, ZHONG Fa-Gang, WANG Xin-Hua, LIU Shou-Ren, ZHU Bin, XING Jun-Fen, SUN Yue. The preparation of oligonucleotide chips for detecting BMPR-IB gene polymorphism in sheep[J]. HEREDITAS, 2007, 29(8): 957-962.

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检测绵羊BMPR-IB基因多态性寡核苷酸芯片的制备

The preparation of oligonucleotide chips for detecting BMPR-IB gene polymorphism in sheep

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