遗传 ›› 2008, Vol. 30 ›› Issue (3): 352-358.doi: 10.3724/SP.J.1005.2008.00352
顾朝辉1, 童强松1, 曾甫清1, 刘媛1, 王智宇1, 郑丽端2, 蔡嘉斌1, 蒋国松1
1. 华中科技大学同济医学院附属协和医院外科, 武汉 430022;
2. 华中科技大学同济医学院附属协和医院病理科, 武汉 430022
GU Chao-Hui1, TONG Qiang-Song1, ZENG Fu-Qing1, LIU Yuan1, WANG Zhi-Yu1, ZHENG Li-Duan2, CAI Jia-Bin1, JIANG Guo-Song1
摘要:
从表达序列标签(expressed sequence tags, ESTs)数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST, 通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列, 构建EST叠加群(contigs), Biolign软件拼接, GeneScan软件预测contigs对应的基因组序列中的外显子、内含子; 针对开放阅读框设计引物序列, 采用RT-PCR从小鼠睾丸组织中克隆新基因的cDNA, 分析该基因在小鼠各脏器中的mRNA表达, 并对测序结果进行生物信息学分析。结果表明: 在小鼠X染色体的1 668~2 011 kb间克隆出一新基因TSEG-1, 全长为510 bp, 开放阅读框为336 bp, 编码111氨基酸, 分子量12.84258 kDa, 等电点11.4000。RT-PCR证实该基因开放阅读框正确, 在小鼠睾丸组织中特异性表达, 且与小鼠其他cDNA 无同源性, 获得GenBank 登录号EU079024。功能区分析发现TSEG-1蛋白可能为一种跨膜蛋白, 跨膜区位于第41~61氨基酸残基。TSEG-1基因与人类睾丸特异性组蛋白2a变异体基因有较高同源性, 在TSEG-1基因5′-端非编码侧翼预测发现存在1个启动子区域, 范围为680 bp。 TSEG-1蛋白可能有4个抗原性位点, 2个特异性蛋白激酶的磷酸化位点, 其亚细胞定位可能位于线粒体。小鼠睾丸特异性基因TSEG-1的克隆为进一步研究其生物学功能和表达调控奠定了基础。