10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

遗传 ›› 2006, Vol. 28 ›› Issue (4): 422-426.

10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

孟彦^{1 2};许尚忠^{2 1};昝林森¹;高雪²;陈金宝²;任红艳²;王兴平

1. 西北农林科技大学动科学院,杨凌712100；2. 中国农业科学院畜牧研究所,北京100094

收稿日期:2005-08-29 修回日期:2005-12-02 出版日期:2006-04-10 发布日期:2006-04-10
通讯作者: 许尚忠

Analysis of Mitochondrial 12S rRNA Gene Polymorphism in Cattle

MENG Yan^{1 2},XU Shang-Zhong^{1 2}, ZAN Lin-Sen¹, GAO Xue²

CHEN Jin-Bao²，REN Hong-Yan²，WANG Xing-Ping^{1. Animal Sciences and Technology College, Northwest A & F University, Shaanxi 712100, China; 2. Institute of Animal Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100094, China

Received:2005-08-29

Revised:2005-12-02

Online:2006-04-10

Published:2006-04-10

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XU Shang-Zhong

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摘要/Abstract

摘要：

以鲁西牛、渤海黑牛、大别山牛、南阳牛、晋南牛、秦川牛、中国西门塔尔牛、日本和牛、海福特牛和安格斯牛10个牛品种共计353头牛为研究对象，利用单链构象多态性（SSCP）分子标记方法对其线粒体DNA 12S rRNA基因进行了多态性分析，结果发现该基因出现分布频率不同的3种单倍型（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ），其中单倍型Ⅰ出现的频率最低，仅在晋南牛1个个体中发现；单倍型Ⅱ在中国本地黄牛中都存在，在中国西门塔尔牛中的分布频率很低，但在3个国外品种海福特牛、安格斯牛和日本和牛中不存在；单倍型Ⅲ在这10个牛品种中均有分布，但以国外品种最丰富。计算平均多态信息含量，发现我国地方品种在0.232～0.423之间，基本属于中度多态，说明我国地方黄牛品种在12S rRNA上多态性比较丰富，国外品种较为贫乏；但是单倍型Ⅰ频率很低有丢失的趋势，需要对其进行保护。

关键词: 线粒体DNA, 牛, SSCP, 12S rRNA基因, 多态性

Abstract: The mitochondrial DNA 12S rRNA in seven Chinese local yellow cattle breeds, one cultivated breed and three imported breeds was studied by single-strand conformation polymorphism (SSCP). Three haplotypes (Ⅰ,Ⅱ, Ⅲ) were detected, with haplotypeⅠfound only in one cattle of the Jinnan breed. Haplotype Ⅱ did not appear in the foreign cattle breeds and low in Chinese-Simmental breed but was rich in Chinese local breeds. Haplotype Ⅲ had the widest distribution and was present in ten cattle breeds. The average polymorphism information content (PIC) for Chinese cattle between 0.232－0.423 was modest, which suggested relative abundance of genetic resources for the Chinese native cattle.

中图分类号:

Q953

孟彦，许尚忠，昝林森，高雪，陈金宝，任红艳，王兴平. 10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析[J]. 遗传, 2006, 28(4): 422-426.

MENG Yan, XU Shang-Zhong, ZAN Lin-Sen, GAO Xue, CHEN Jin-Bao, REN Hong-Yan, WANG Xing-Ping. Analysis of Mitochondrial 12S rRNA Gene Polymorphism in Cattle[J]. HEREDITAS, 2006, 28(4): 422-426.

[1]	宋睿嘉, 韩露, 孙海峰, 沈彬. 线粒体DNA碱基编辑技术研究进展[J]. 遗传, 2023, 45(8): 632-642.
[2]	马钧, 樊安平, 王武生, 张金川, 江晓军, 马瑞军, 贾社强, 刘飞, 雷初朝, 黄永震. 全基因组重测序解析秦川牛保种群遗传多样性和遗传结构[J]. 遗传, 2023, 45(7): 602-616.
[3]	王雪倩, 张庆珍, 程鹏, 董婷婷, 李卫国, 周喆, 王升启. 中国汉族人群66个InDel基因座的遗传多态性[J]. 遗传, 2022, 44(4): 335-345.
[4]	李以格, 张丹丹. 后GWAS时代结直肠癌致病SNP功能机制的研究进展[J]. 遗传, 2021, 43(3): 203-214.
[5]	王浩宇, 胡渝涵, 曹悦岩, 朱强, 黄雨果, 李茜, 张霁. 基于全基因组数据的AI-SNPs筛选及大陆次级区域内群体遗传结构差异研究[J]. 遗传, 2021, 43(10): 938-948.
[6]	王玉琢, 张一鸣, 董晓莲, 王学才, 朱建福, 王娜, 江峰, 陈跃, 姜庆五, 付朝伟. 2型糖尿病易感基因SNP位点对生活方式干预降低血糖应答效果的修饰效应[J]. 遗传, 2020, 42(5): 483-492.
[7]	师睿, 张毅, 王雅春, 黄涛, 卢国昌, 岳涛, 卢振西, 黄锡霞, 卫新璞, 冯书堂, 陈军, 乌兰·卡格德尔, 茹先古丽·阿不力孜, 努尔胡马尔·木合塔尔. 利用SNP芯片信息评估新疆近交牛基因组纯合度[J]. 遗传, 2020, 42(5): 493-505.
[8]	陈会友, 张建敏, 李柏森, 邓永琳, 张龚炜. 犏牛雄性不育的减数分裂基因表达与表观遗传调控研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(11): 1081-1092.
[9]	王冰源, 牟玉莲, 李奎, 刘志国. 农业动物干细胞研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(11): 1073-1080.
[10]	梁文权,侯豫,赵存友. 精神分裂症相关单核苷酸多态性调控microRNA功能研究进展[J]. 遗传, 2019, 41(8): 677-685.
[11]	张晴,平杰,张昊翔,康波,李元丰,周钢桥. MKL1基因多态性与高原环境适应性的遗传关联研究[J]. 遗传, 2019, 41(7): 634-643.
[12]	张婕妤,初亚男,邹秉杰,张晏洁,封利颖. 基于级联核酸侵入反应的real-time PCR法检测咽拭子样本中UGT1A16*基因多态性[J]. 遗传, 2018, 40(8): 668-675.
[13]	彭哲也,唐紫珺,谢民主. 机器学习方法在基因交互作用探测中的研究进展[J]. 遗传, 2018, 40(3): 218-226.
[14]	刘莉莉, 郭爱伟, 吴培福, 陈粉粉, 杨亚晋, 张勤. 敲降VPS28基因对中国荷斯坦奶牛乳脂合成的调控[J]. 遗传, 2018, 40(12): 1092-1100.
[15]	杨熳,卢冰婕,段媛媛,陈晓峰,马建岗,郭燕. 骨质疏松症易感基因BDNF的遗传学关联分析及功能研究[J]. 遗传, 2017, 39(8): 726-736.