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2015年, 第2期 刊出日期:2015-02-20
SSRs(Simple sequence repeats)是一类广泛存在于动植物基因组的DNA短串联重复序列,是重要的基因组分子标记。比较不同基因组同源SSR的差异,有利于了解相近物种间的进化过程。棉花已经完成了两个二倍体基因组:雷蒙德氏棉基因组(D5)和亚洲棉基因组(A2)的全基因组测序,四倍体基因组陆地棉(AD1)的限制性酶切基因组测序数据也已经发布。本研究通过全基因组SSR扫描,识别3个基因组之间的同源SSR,并比较它们之间同源SSR重复序列的差异,尤其是对重复序列长度的变化进行了比较和分析。结果发现,A组和D组同源SSR的分布规律非常相似,但A组与AD组同源SSR的
保守性强于D组与AD组同源SSR的保守性。两个二倍体基因组与四倍体基因组的同源SSR相比较,重复序列长度增长的SSR数量是长度缩短的SSR数量的数倍。可以推测,四倍体基因组在进化过程中,由于基因组融合,导致SSR的重复序列长度变化速率与二倍体基因组有所差异,而这种差异可能导致了四倍体基因组SSR重复序列长度与二倍体相比有变短的趋势。详见本期孙高飞、何守朴等“棉属四倍体AD1与二倍体A2、D5基因组的同源SSR分析”一文(第192~203页)。
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综述
SIRT3与细胞代谢及心血管疾病的相关性
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