遗传 ›› 2007, Vol. 29 ›› Issue (5): 581-581―586.doi: 10.1360/yc-007-0581
杨秀芹1, 刘惠1, 郭丽娟1, 许尧1, 刘娣1,2
1. 东北农业大学动物科技学院, 哈尔滨 150030;
2. 黑龙江省农业科学院, 哈尔滨 150086
YANG Xiu-Qin1, LIU Hui1, GUO Li-Juan1, XU Yao1, LIU Di1,2
摘要:
为了进一步研究CAPN1基因变异与肉嫩度的关系, 寻找与猪嫩度性状相关的分子标记, 对CAPN1基因组进行了克隆、测序, 并利用PCR-SSCP方法对其编码区序列进行了分子扫描, 寻找多态位点, 分析不同基因型在野猪、民猪、大白猪中的种间分布规律。获得了猪CAPN1基因的15个内含子序列; 根据GenBank上提供的CAPN1 CDS及克隆的内含子序列设计了5对多态性引物进行PCR-SSCP分析; 共找到8个SNPs, 其中7个位于外显子上, 1个位于内含子上, 并且外显子上的突变有3个是错义突变, 分别造成了蛋白质多肽链上第54位氨基酸的S/T、第192位氨基酸的G/E、第363位氨基酸的V/I替代; χ2独立性检验表明不同基因型在大白猪与野猪、民猪之间存在着极显著的差异(P<0.01), 野猪和民猪之间除了S1引物3种基因型的分布存在显著差异外(0.01<P<0.05), 其他引物上差异不显著(P>0.05)。这些多态位点具有成为分子标记的潜在可能。