猪骨骼肌快肌肌钙蛋白C2基因的cDNA克隆与表达分析

遗传 ›› 2006, Vol. 28 ›› Issue (8): 949-955.

猪骨骼肌快肌肌钙蛋白C2基因的cDNA克隆与表达分析

田兴国, 陈瑶生, 凌飞, 梅盈洁, 王翀, 罗永发, 李加琪

华南农业大学动物科学学院, 广州 510642

收稿日期:2006-01-12 修回日期:2006-03-23 出版日期:2006-08-10 发布日期:2006-08-10
通讯作者: 李加琪

Cloning and Expression of the Pig Fast Skeletal Muscle Troponin C Gene

TIAN Xing-Guo , CHEN Yao-Sheng, LING Fei, MEI Ying-Jie, WANG Chong,
LUO Yong-Fa, LI Jia-Qi

College of Animal Sciences, South China Agricultural University, Guangzhou 510642, China

Received:2006-01-12 Revised:2006-03-23 Online:2006-08-10 Published:2006-08-10
Contact: LI Jia-Qi

摘要/Abstract

摘要： 从人骨骼肌快肌肌钙蛋白C2（TNNC2）基因出发，在dbEST数据库中进行同源性搜索，找到一个有较高同源性且在猪背最长肌中表达EST（BM083186）。通过电子克隆和进一步RT-PCR实验验证，获得猪TNNC2基因全长cDNA序列，其全长843bp，开放阅读框为201～683bp，编码有160个氨基酸。同源性分析结果表明，与人、鼠的骨骼肌快肌肌钙蛋白C2基因cDNA编码区（CDS）同源性分别为93.6％、90.5％，蛋白序列同源性均为97.5%。多种组织的半定量RT-PCR研究表明，该基因在骨骼肌中表达，并且在杜洛克猪背最长肌中的表达比兰塘猪高。

关键词: 电子克隆, 猪, 骨骼肌快肌肌钙蛋白C2基因

Abstract:

A pig skeletal muscle expressed sequence tag (EST, accession number BM083186) was found to encode amino acid sequences with high homology to human TNNC2. In silico cloning obtained a 843 bp sequence which we named pig fast skeletal troponin C gene (TNNC2). The open reading frame of TNNC2 was between nucleotides 201~683, and was confirmed by RT-PCR. The gene encoded a 160 amino acid residue protein and had the highest similarity with human and mouse homologues, with percent identities being 93.6％, 90.5％, respectively. Semi-quantitative RT-PCR analysis of mRNA from different normal tissues indicted that the TNNC2 gene was expressed in the skeletal muscle and the levels of expression were higher in the longissimus dorsi of the Duroc pig than in the same tissue of the Lantang pig.

中图分类号:

Q343

田兴国，陈瑶生，凌，飞，梅盈洁，王翀，罗永发，李加琪. 猪骨骼肌快肌肌钙蛋白C2基因的cDNA克隆与表达分析[J]. 遗传, 2006, 28(8): 949-955.

TIAN Xing-Guo, CHEN Yao-Sheng, LING Fei, MEI Ying-Jie, WANG Chong, LUO Yong-Fa, LI Jia-Qi . Cloning and Expression of the Pig Fast Skeletal Muscle Troponin C Gene[J]. HEREDITAS, 2006, 28(8): 949-955.

[1]	李亚楠, 张贤君, 张宁, 梁雅琳, 张宇星, 招华兴, 李紫聪, 黄思秀. 过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响[J]. 遗传, 2023, 45(1): 67-77.
[2]	高菲, 王煜, 杜嘉祥, 杜旭光, 赵建国, 潘登科, 吴森, 赵要风. 遗传修饰猪模型在生物医学及农业领域研究进展及应用[J]. 遗传, 2023, 45(1): 6-28.
[3]	唐湘薇, 楚丹, 颜赛娜, 尹艳飞, 卞桥, 翁波, 陈斌, 冉茂良. miR-191靶向BDNF基因通过激活PI3K/AKT信号通路促进猪未成熟支持细胞增殖[J]. 遗传, 2021, 43(7): 680-693.
[4]	周子文, 王雪, 丁向东. 基于高密度SNP标记估计群体间遗传关联[J]. 遗传, 2021, 43(4): 340-349.
[5]	彭定威, 李瑞强, 曾武, 王敏, 石翾, 曾检华, 刘小红, 陈瑶生, 何祖勇. 编辑MSTN半胱氨酸节基元促进两广小花猪肌肉生长[J]. 遗传, 2021, 43(3): 261-270.
[6]	魏强, 奥岩, 杨漫漫, 陈涛, 韩虎, 张兴举, 王然, 夏秋菊, 姜芳芳, 李勇. 利用全基因组重测序技术鉴定五指山猪GHR突变体转基因插入位点[J]. 遗传, 2021, 43(12): 1149-1158.
[7]	韩程程, 夏凯, 龚茹莹, 吴栩涵, 张蕾, 梁新乐. 适于检测非洲猪瘟病毒的点亮Spinach-p54 RNA适配体的设计及应用[J]. 遗传, 2021, 43(12): 1170-1178.
[8]	邢宝松, 王璟, 陈俊峰, 马强, 任巧玲, 张家庆, 张华, 滑留帅, 孙加节, 曹海. 去势和非去势公猪背最长肌circRNA差异表达分析[J]. 遗传, 2021, 43(11): 1066-1077.
[9]	周俊, 赵成成, 吴霄, 石俊松, 周荣, 吴珍芳, 李紫聪. 猪耳成纤维细胞转录组异质性及对核移植胚胎发育的潜在影响[J]. 遗传, 2020, 42(9): 898-915.
[10]	任巧玲, 张家庆, 陆东锋, 王璟, 陈俊峰, 马强, 白献晓, 郭红霞, 高彬文, 邢宝松. 乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析[J]. 遗传, 2020, 42(4): 388-402.
[11]	杨岸奇, 陈斌, 冉茂良, 杨广民, 曾诚. 基因组选择在猪杂交育种中的应用[J]. 遗传, 2020, 42(2): 145-152.
[12]	王冰源, 牟玉莲, 李奎, 刘志国. 农业动物干细胞研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(11): 1073-1080.
[13]	敖政, 陈祥, 吴珍芳, 李紫聪. 体细胞克隆猪发育异常研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(10): 993-1003.
[14]	莫健新,王豪强,黄广燕,蔡更元,吴珍芳,张献伟. 微生物源果胶酶在猪PK15细胞中异源表达及其酶学性质分析[J]. 遗传, 2019, 41(8): 736-745.
[15]	周李生, 赵为民, 涂枫, 吴云鹤, 任守文, 方晓敏. 猪乳头性状生理学和遗传学研究进展[J]. 遗传, 2019, 41(5): 384-390.