SIM1基因第8外显子的SNP对猪背膘厚的影响

doi:10.3724/SP.J.1005.2008.00755

遗传 ›› 2008, Vol. 30 ›› Issue (6): 755-759.doi: 10.3724/SP.J.1005.2008.00755

SIM1基因第8外显子的SNP对猪背膘厚的影响

郭晓令; 陈哲; 赵晓枫; 徐宁迎

浙江大学动物科学学院, 杭州 310029

收稿日期:2007-10-27 修回日期:2008-01-20 出版日期:2008-06-10 发布日期:2008-06-10
通讯作者: 徐宁迎

Effect of SNP in the exon 8 of SIM1 gene on backfat thickness in pigs

GUO Xiao-Ling;CHEN Zhe;ZHAO Xiao-Feng;XU Ning-Ying

College of Animal Science, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China

Received:2007-10-27 Revised:2008-01-20 Online:2008-06-10 Published:2008-06-10
Contact: XU Ning-Ying

摘要/Abstract

摘要：

采用PCR-SSCP方法检测了约克夏、杜洛克、皮特兰、长白猪、嘉兴黑猪和金华猪6个品种共169头猪的SIM1基因外显子8的SNP及其基因型频率。结果共发现CC、CT、TT 3种基因型, 其基因型频率在国内外猪品种之间具有较大差异。其中, 国内猪种嘉兴黑猪和金华猪只存在TT基因型, 而国外猪种约克夏、杜洛克、皮特兰、长白猪则都存在3种基因型。用最小二乘法分析SNP对长白猪、约克夏猪和杜洛克猪的背膘厚的效应的结果表明, 纯合基因型个体的背膘厚大于杂合基因型个体。SIM1基因型对国外猪种背膘厚有显著效应(P< 0.05), 并且不同部位效应不同。

关键词: 背膘厚, 猪, SNP, SIM1基因

Abstract:

SNP in exon 8 of the Single-minded 1 (SIM1) gene was detected using PCR-SSCP in 169 pigs of 6 pig breeds including Yorkshire, Duroc, Pietrain, Landrace, Jiaxinghei and Jinhua. The results showed three genotypes (CC, CT, TT) were found and their frequencies between domestic and foreign breeds were different. Only one genotype TT was found in Jiaxinghei and Jinhua pigs, but three genotypes were detected in each foreign breed. The effects of this SNP on backfat thickness in Landrace, Yorkshire and Duroc were estimated using least square method. The homozygote pigs had thicker backfat than the heterozygote ones. The significant effect of various genotypes was found in foreign breeds (P < 0.05). SIM1 had different effects on backfat thickness of different points.

郭晓令，陈哲，赵晓枫，徐宁迎. SIM1基因第8外显子的SNP对猪背膘厚的影响[J]. 遗传, 2008, 30(6): 755-759.

GUO Xiao-Ling, CHEN Zhe, ZHAO Xiao-Feng, XU Ning-Ying. Effect of SNP in the exon 8 of SIM1 gene on backfat thickness in pigs[J]. HEREDITAS, 2008, 30(6): 755-759.

[1]	李亚楠, 张贤君, 张宁, 梁雅琳, 张宇星, 招华兴, 李紫聪, 黄思秀. 过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响[J]. 遗传, 2023, 45(1): 67-77.
[2]	高菲, 王煜, 杜嘉祥, 杜旭光, 赵建国, 潘登科, 吴森, 赵要风. 遗传修饰猪模型在生物医学及农业领域研究进展及应用[J]. 遗传, 2023, 45(1): 6-28.
[3]	郭晓媛, 孙昌春, 薛思瑶, 赵慧, 江丽, 李彩霞. 49AISNP：东亚北方三个族群遗传来源推断[J]. 遗传, 2021, 43(9): 880-889.
[4]	唐湘薇, 楚丹, 颜赛娜, 尹艳飞, 卞桥, 翁波, 陈斌, 冉茂良. miR-191靶向BDNF基因通过激活PI3K/AKT信号通路促进猪未成熟支持细胞增殖[J]. 遗传, 2021, 43(7): 680-693.
[5]	周子文, 王雪, 丁向东. 基于高密度SNP标记估计群体间遗传关联[J]. 遗传, 2021, 43(4): 340-349.
[6]	彭定威, 李瑞强, 曾武, 王敏, 石翾, 曾检华, 刘小红, 陈瑶生, 何祖勇. 编辑MSTN半胱氨酸节基元促进两广小花猪肌肉生长[J]. 遗传, 2021, 43(3): 261-270.
[7]	魏强, 奥岩, 杨漫漫, 陈涛, 韩虎, 张兴举, 王然, 夏秋菊, 姜芳芳, 李勇. 利用全基因组重测序技术鉴定五指山猪GHR突变体转基因插入位点[J]. 遗传, 2021, 43(12): 1149-1158.
[8]	韩程程, 夏凯, 龚茹莹, 吴栩涵, 张蕾, 梁新乐. 适于检测非洲猪瘟病毒的点亮Spinach-p54 RNA适配体的设计及应用[J]. 遗传, 2021, 43(12): 1170-1178.
[9]	邢宝松, 王璟, 陈俊峰, 马强, 任巧玲, 张家庆, 张华, 滑留帅, 孙加节, 曹海. 去势和非去势公猪背最长肌circRNA差异表达分析[J]. 遗传, 2021, 43(11): 1066-1077.
[10]	周俊, 赵成成, 吴霄, 石俊松, 周荣, 吴珍芳, 李紫聪. 猪耳成纤维细胞转录组异质性及对核移植胚胎发育的潜在影响[J]. 遗传, 2020, 42(9): 898-915.
[11]	妥晓梅, 朱东丽, 陈晓峰, 荣誉, 郭燕, 杨铁林. 骨质疏松易感SNP rs4325274通过增强子远程调控SOX6基因的功能机制研究[J]. 遗传, 2020, 42(9): 889-897.
[12]	刘明, 李祎, 杨亚芳, 晏于文, 刘凡, 李彩霞, 曾发明, 赵雯婷. 中国汉族人群脸部特征相关SNP位点研究[J]. 遗传, 2020, 42(7): 680-690.
[13]	任巧玲, 张家庆, 陆东锋, 王璟, 陈俊峰, 马强, 白献晓, 郭红霞, 高彬文, 邢宝松. 乏情和发情初产母猪下丘脑-垂体-卵巢轴中lincRNAs表达谱比较分析[J]. 遗传, 2020, 42(4): 388-402.
[14]	刘杨, 孙昌春, 马咪, 王玲, 赵雯婷, 马泉, 季安全, 刘京, 李彩霞. 74-plex SNPs复合检测体系在中国人群中的族群推断研究[J]. 遗传, 2020, 42(3): 296-308.
[15]	杨岸奇, 陈斌, 冉茂良, 杨广民, 曾诚. 基因组选择在猪杂交育种中的应用[J]. 遗传, 2020, 42(2): 145-152.

SIM1基因第8外显子的SNP对猪背膘厚的影响

Effect of SNP in the exon 8 of SIM1 gene on backfat thickness in pigs

PDF (PC)

可视化

被引次数

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics