遗传 ›› 2005, Vol. 27 ›› Issue (2): 173-180.
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李 华1 ~3;张亚平1;邱祥聘 3
LI Hua1~3;ZHANG Ya-Ping1;QIU Xiang-Pin3
摘要: 运用PCR-SSCP和克隆测序对中国部分猪种的SLA-DQB基因外显子2的多态性分析表明:有功能的DQB基因有68个新等位基因,假基因(SLA-DXB)等位基因有5个。各等位基因的数量分布极其不平衡,而且许多品种都表现出共享等位基因。9个主要等位基因中, C08广泛分布在中国猪种的6大地方类型11个品种及云南和四川野猪中,它为中国猪种特有的共享等位基因,占总数的55.10%。在单一的个体中拥有5条以上序列,说明SLA-DQB基因座在某些品种中拷贝数为3个。SLA-DQB外显子2的等位基因核苷酸和氨基酸多态变异位点分别高达81个和49个,等位基因多样度(H=0.889)以及核苷酸多样度(Pi =0.047)都很高,总体表现为β折叠区的Pi值均高于α螺旋区。综合分析表明华南型、西南型猪H和Pi均较高,高原型的藏猪最低。类群内遗传距离排序与Pi值高低排序一样,可见各地方类型中核苷酸替换的差异正比于核苷酸多样度。类群间遗传距离比较,江海型与华北型间的距离最大,而华中型和高原型间的遗传距离最小。