微卫星标记分析罗非鱼群体的遗传潜力

doi:10.3724/SP.J.1005.2011.00768

遗传 ›› 2011, Vol. 33 ›› Issue (7): 768-775.doi: 10.3724/SP.J.1005.2011.00768

微卫星标记分析罗非鱼群体的遗传潜力

杨弘¹, 李大宇¹, 曹祥^{1, 2}, 邹芝英¹, 肖炜¹, 祝璟琳¹

1. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种与养殖生物学重点开放实验室, 无锡 214081 2. 南京农业大学无锡渔业学院, 无锡 214081

收稿日期:2010-08-31 修回日期:2011-01-18 出版日期:2011-07-20 发布日期:2011-07-25
通讯作者: 杨弘 E-mail:yangh@ffrc.cn
基金资助:
国家科技支撑计划专题(编号：2006BAD01A1202), 2007年公益性行业(农业)科研专项(编号：3-49), 现代农业产业技术体系建设专项资金(编号：nycytx-48), 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(编号：2007JBFA02)和农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金课题(编号：BM2007-13)资助

Genetic potential analysis of six Tilapia populations by microsatellite DNA markers

YANG Hong¹, LI Da-Yu¹, CAO Xiang^{1, 2}, ZOU Zhi-Ying¹, XIAO Wei¹, ZHU Jing-Lin¹

1. Key Laboratory of Genetic Breeding and Aquaculture Biology, Ministry of Agriculture, Freshwater Fisheries Research Center, Chinese Academy of Fishery Sciences, Wuxi 214081, China 2. Wuxi Fisheries College, Nanjing Agricultural University, Wuxi 214081, China

Received:2010-08-31 Revised:2011-01-18 Online:2011-07-20 Published:2011-07-25

摘要/Abstract

摘要： 利用25个微卫星标记, 对奥利亚罗非鱼2个群体[“夏奥1号”(ZA)、广西群体(GA)]和尼罗罗非鱼4个群体[埃及品系(ZN)、88品系(XN)、广西群体(GN)、美国品系(MN)]进行检测。共检测到7 775个扩增片段, 长度在100~400 bp; 等位基因数3~8个不等, 共计143个等位基因; 平均每个基因座扩增得到5.72个等位基因。各群体平均观测杂合度(Ho)在0.7253~0.8160之间, 平均期望杂合度(He)在0.5146~0.6834之间, 平均多态信息含量(PIC)在0.4212~0.6105之间, 平均有效等位基因数(Ae)在2.20~3.23之间。ZA与GA遗传相似系数最高(0.9130), ZA与ZN遗传相似系数最低(0.4352)。总的说来, 4个尼罗罗非鱼群体的遗传潜力较高, 2个奥利亚罗非鱼群体的遗传潜力适中。

关键词: 微卫星, 遗传多样性, 遗传潜力, 奥利亚罗非鱼, 尼罗罗非鱼

Abstract: Twenty five microsatellite loci were used to analyze two blue tilapia populations [“Xia’ao 1” (ZA), Guangxi population] and four nile tilapia populations [Egypt strain (ZN), 88 strain (XN), Guangxi population (GN), American strain (MN)]. A total of 7775 fragments ranging from 100 bp to 400 bp in length were obtained. Three to eight alleles were amplified in 25 loci and 143 alleles in all the six populations. The average number of alleles in each locus was 5.72. The average values of observed heterozygosity (Ho) ranged from 0.7253 to 0.8160, the average expected heterozygosity (He) ranged from 0.5146 to 0.6834, the average polymorphic information content (PIC) ranged from 0.4212 to 0.6105, and the number of average effective alleles (Ae) ranged from 2.20 to 3.23. The highest genetic similarity index was 0.9130 (between ZA and GA); and the lowest was 0.4352 (between ZA and ZN). The results showed that the four nile tilapia populations contained a high level of genetic potential, and the two blue tilapia populations were moderate.

Key words: genetic potential, O. Aureus, O. niloticus, microsatellite, genetic diversity

杨弘，李大宇，曹祥，邹芝英，肖炜，祝璟琳. 微卫星标记分析罗非鱼群体的遗传潜力[J]. 遗传, 2011, 33(7): 768-775.

YANG Hong, LI Da-Yu, CAO Xiang, JU Zhi-Yang, XIAO Wei, CHU Jing-Lin. Genetic potential analysis of six Tilapia populations by microsatellite DNA markers[J]. HEREDITAS, 2011, 33(7): 768-775.

参考文献

[1] 夏德全. 中国罗非鱼养殖现状及发展前景. 科学养鱼, 2000, (5): 1-1, 21.
[2] 崔和. 中国罗非鱼产业现状. 海洋与渔业, 2008, (1): 3-5.
[3] 王楚松, 夏德全, 胡玫, 王和海. 奥尼鱼(O. nilotica♀×O. aurea♂)杂种优势利用的研究. 淡水渔业, 1989, (6): 14-l5, 13.
[4] 张云武, 张亚平. 微卫星及其应用. 动物学研究, 2001, 22(4): 315-320.
[5] 曹君, 霍雅鹏, 杜杨, 张宇婷, 万冬梅. 微卫星DNA在亲权关系鉴定中的应用. 辽宁大学学报(自然科学版), 2010, 37(2): 156-159.
[6] 盛岩, 郑蔚虹, 裴克全, 马克平. 微卫星标记在种群生物学研究中的应用. 植物生态学报, 2002, 26(增刊): 119-126.
[7] Kocher TD, Lee WJ, Sobolewska H, Penman D, McAndrew B. A genetic linkage map of a cichlid fish, the tilapia (Oreochromis niloticus). Genetics, l998, 148(3): 1225-l232.
[8] Lee BY, Lee WJ, stree1man JT, Carleton KL, Howe AE, Hulata G, Slettan A, Stern JE, Terai Y, Kocher TD. A sec-ond-generation genetic linkage map of tilapia (Oreochromis spp.). Genetics, 2005, 170(1): 237-244.
[9] 张庭, 卢迈新, 叶星, 全迎春, 高风英, 黄樟翰, 白俊杰. 四个奥利亚罗非鱼群体的微卫星分析. 水生生物学报, 2009, 33(3): 498-508.
[10] 蒋家金, 李瑞伟, 叶福良. 罗非鱼4个选育群体遗传结构SSR分析. 广东海洋大学学报, 2008, 28(4): 10-14.
[11] 李先仁, 李思发, 唐首杰, 蔡完其. 尼罗罗非鱼8个养殖群体遗传差异的微卫星分析. 上海海洋大学学报, 2009, 18(1): 1-7.
[12] Sambrook J, Russell DW. Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed. Beijing: Science Press, 2002.
[13] Botstein D, White RL, Skolnick M, Davis RW. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am J Human Genet, 1980, 32(3): 314-331.
[14] Wright S. Evolution and the genetics of populations. Chicago: University of Chicago Press, 1978.
[15] 袁文华, 刘丽, 刘楚吾, 谭围. 奥尼罗非鱼及其亲本的微卫星分析. 现代农业科学, 2009, 16(6): 27-30, 47.
[16] 王进科, 夏德全, 吴婷婷. 中国奠基群奥利亚罗非鱼遗传多态性的DNA指纹图谱. 南京农业大学学报, 2000, 23(3): 61-63.
[17] 李大宇, 殷倩茜, 侯宁, 孙效文, 梁利群. 黄颡鱼(Pelteobagrus eupogon)不同生态地理分布群体遗传多样性的微卫星分析. 海洋与湖沼, 2009, 40(4): 460-469.
[18] 李家乐, 李思发. 中国大陆尼罗罗非鱼引进及其研究进展. 水产学报, 2001, 25(1): 90-95.
[19] 苏从成, 张海容. 遗传平衡定律的推广形式及其应用. 畜牧兽医杂志, 2009, 28(6): 24-26.
[20] Slatkin M. Gene flow and the geographic structure of natural populations. Science, 1987, 236(4803): 787-792.
[21] Shaklee JB, Tamaru CS, Waples RS. Speciation and evolution of marine fishes studied by the electrophoretic analysis of proteins. Pac Sci, 1982, 36(2): 141-157.
[22] Crawford AM, Littlepohn RP. The use of DNA markers in deciding conservation priorities in sheep and other livestock. Anim Genet Res Inf, 1998, 23(1): 21-26.
[23] 孙少华, 桑润滋, 师守堃, 贾青, 李运起, 李雪梅, 田树军, 高聚山, 闫国志, 丁玉臣, 黄亚新. 肉牛杂交优势预测、评估及其应用研究. 遗传学报, 2000, 27(7): 580-589.
[24] Taniguchi N. Genetic factors in broodstock management for seed production. Fish Biol Fisher, 2003, 13(2): 177-185.
[25] Kimura M, Crow JF. The number of alleles that can be main-tained in a finite population. Genetics, 1964, 49(4): 725-738.
[26] García FJ, Chikhi L, Bonhomme F. Microsatellite polymorphism and population subdivision in natural populations of European sea bass, Dicentrarchus labrax (Linnaeus, 1758). Mol Ecol, 1997, 6(1): 51-62.

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[1]	马钧, 樊安平, 王武生, 张金川, 江晓军, 马瑞军, 贾社强, 刘飞, 雷初朝, 黄永震. 全基因组重测序解析秦川牛保种群遗传多样性和遗传结构[J]. 遗传, 2023, 45(7): 602-616.
[2]	寇洁, 李严, 王鹏, 刘红, 刘佳文, 王涓, 王也, 张亮, 沈富军. 大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化[J]. 遗传, 2022, 44(3): 253-266.
[3]	徐志伟, 魏云林, 季秀玲. 假单胞菌噬菌体基因组学研究进展[J]. 遗传, 2020, 42(8): 752-759.
[4]	郑建敏,罗江陶,万洪深,李式昭,杨漫宇,李俊,杨恩年,蒋云,刘于斌,王相权,蒲宗君. 四川省小麦育成品种系谱分析及发展进程[J]. 遗传, 2019, 41(7): 599-610.
[5]	周彦, 王超杰, 朱纯超, 陈江荣, 程酩, 邓宇亮, 郭妍. 组织单腺体内单细胞的基因变异分析方法[J]. 遗传, 2017, 39(8): 753-762.
[6]	赵永欣, 李孟华, 赵要风. 中国绵羊起源、进化和遗传多样性研究进展[J]. 遗传, 2017, 39(11): 958-973.
[7]	弓弦,张超,伊利亚斯·艾萨,时瑛,杨雪唯,努尔斯曼古丽奥斯曼,关亚群,徐书华. 2型糖尿病易感候选基因在世界不同人群中的多样性比较分析[J]. 遗传, 2016, 38(6): 543-559.
[8]	黄益敏夏梦颖黄石. 遗传多样性上限假说所揭示的进化历程[J]. 遗传, 2013, 35(5): 599-606.
[9]	温莹逯晓萍任锐米福贵韩平安薛春雷. 高丹草EST-SSR标记的开发及其遗传多样性[J]. 遗传, 2013, 35(2): 225-232.
[10]	李铎，柴志欣，姬秋梅，张成福，信金伟. 西藏牦牛微卫星DNA的遗传多样性[J]. 遗传, 2013, 35(2): 175-184.
[11]	马志杰，钟金城，韩建林，徐惊涛，刘仲娜，白文林. 牦牛分子遗传多样性研究进展[J]. 遗传, 2013, 35(2): 151-160.
[12]	傅建军，李家乐，沈玉帮，王荣泉，宣云峰，徐晓雁，陈勇. 草鱼野生群体遗传变异的微卫星分析[J]. 遗传, 2013, 35(2): 192-201.
[13]	杨昭庆，褚嘉祐. 中国人类遗传多样性研究进展[J]. 遗传, 2012, 34(11): 1351-1364.
[14]	于辉，刘荣辉，李华，左启祯，李岩，吴珍芳. 猪5个群体SLA微卫星遗传多样性[J]. 遗传, 2012, 34(11): 1427-1433.
[15]	李娟，张克勤. 微生物的遗传多样性[J]. 遗传, 2012, 34(11): 1399-1408.